预付所得税时，不能预先扣除研发费用。根据《企业所得税优惠政策处理办法》所附《企业所得税优惠项目登记目录（2015年版）》的规定，“开发新技术，新产品和新工艺”只能这是“享受汇款”，预付款期无法享受此折扣。
相关税收法规：
1.国家税务总局关于印发《企业所得税优惠政策处理办法的公告》（国家税务总局公告2015年第76号）
2.财政部，国家税务总局，科学技术部，《关于完善研究开发费用税前超额扣除政策的通知》（财税〔2015〕119号）。
企业所得税研发费用的额外抵扣，是企业为开发新技术，新产品，新工艺而发生的研发费用，可以在计算应纳税所得额时予以抵扣。不能随意规定并在所得税前扣除，只能以研发费用的50％扣除；如果形成无形资产，则应按无形资产成本的150％摊销。
附件：《中华人民共和国企业所得税法》第30条第1款规定，企业为开发新技术，新产品和新工艺而产生的研发费用可能是在计算应纳税所得额时添加计算扣除额。扣除研发费用的50％；如果形成无形资产，则按无形资产成本的150％摊销。
《中华人民共和国企业所得税法实施条例》第95条规定，《企业所得税法》第30条第1款所指的研发费用的额外扣除是指企业产品和新工艺产生的研发费用，如果没有形成无形资产并计入当期损益的，则按规定实际扣除的基础上，将研发费用的50％计入当期损益。扣除。摊销额的150％。
从税法和实施条例可以看出，根据研发费用是否资本化以形成无形资产，可将扣除额分为两种方式，但允许的税前扣除总额为一样，就是两者都是真实的发生研发费用的150％。
财政部，国家税务总局，《关于企业技术创新有关企业所得税优惠政策的通知》（财税[2006] 88号），详细规定了哪些技术，新产品和新工艺。属于新技术，新产品和新工艺开发过程中产生的技术开发费，包括新产品设计费，工艺法规制定费，设备调整费，原材料和半成品试生产费，技术书籍材料费，中间国家计划中未包含的实验费用，研究人员的薪金，用于研究和开发的仪器和设备的折旧，委托其他单位和个人进行科学研究的试生产的费用以及与新产品和技术研究的试生产直接相关的其他费用
适用范围。根据《财政部国家税务总局关于扩大企业技术开发费用附加扣除政策适用范围的通知》（财税[2003] 244号），实施各种所有权的健全和工业企业，实施审计并征收企业所得税，可享受企业所得税减免技术开发费用的优惠政策。新的“公司政策”对受额外扣减的企业的规模或地位没有施加任何限制。
税收管理。根据国家税务总局关于取消企业所得税审批项目分散化管理后续工作的通知（国税发〔2004〕82号），该项目为技术开发费扣除项目。已被取消，纳税人可以税收政策规定了扣除额的自我申报。但是，取消批准并不意味着取消管理。企业必须具有良好的账目，并且能够准确地从不同的会计科目中收取实际的技术开发费用。
企业在独立申报扣除额时应注意：
首先，纳税人享有扣除技术开发成本的政策。它必须具有完整的帐户，并且能够准确地收集不同会计科目产生的实际技术开发成本。
其次，纳税人应提交技术项目开发计划（项目建议书）和技术开发费预算，技术研发专门机构的编制以及年度纳税申报中的专业人员名单，以及实际的技术上年度和本年度的开发费。相关物料，例如有效项目和发生金额。
第三是纳税人产生的技术开发费。国家财政和上级主管部门分配的任何部分，不得在税前扣除，也不计算应纳税所得额。
第四，纳税人在一个纳税年度中产生的实际技术开发费是根据规定扣除100％，在扣除该当年实际金额的50％后才允许扣除公司所得税;所产生的技术开发成本中不足以在当年扣除的部分可以结转并从以后年度的企业所得税应纳税所得额中扣除。扣除的最长期限不得超过5年。
误解1：如果您除了及时扣税之外还没有享受研发费用，那您就不会享受
财税〔2015〕119号规定，如果企业满足本通知规定的研发费用的额外抵扣条件，但未能在2016年1月1日后及时享受税收优惠，则可以享有追溯性和备案程序，追溯期最长为3年。
因此，那些在2016年1月1日之后未及时享受税收优惠的人，可以进行追溯（追溯期最长为3年），以享受并执行申报程序。
误区2：仅可扣除直接从事研发活动的人员的工资
财税〔2015〕119号规定，直接雇用人员的工资，基本养老保险费，基本医疗保险费，失业保险费，工伤保险费，生育保险费和住房公积金在研发活动和外部就业中研发人员的人工费用在允许扣除的研发费用范围内。
因此，不仅可以根据研发费用扣除直接从事研发活动的人员的工资，而且还可以扣除基本养老保险，基本医疗保险，失业保险，工伤保险，生育保险保险和住房公积金。允许基于研发费用的其他扣除。
误区三：无法扣除与研发活动直接相关的差旅和会议费用
财税〔2015〕119号规定，在可抵扣研发费用总额中，不得抵扣不超过10％，与研发活动直接相关的其他费用，可以按照研发费用扣除。 D费用，例如技术书籍和材料费，材料翻译费...误解1：如果您没有及时享受研发费用和税收减免，您将无法享受
财税〔2015〕119号规定，在可抵扣研发费用总额中，不得抵扣不超过10％，与研发活动直接相关的其他费用，可以按照研发费用扣除。 D费用，例如技术书籍和材料费，材料翻译费，专家咨询费，高科技研发保险费，研发成果检索，分析，评估，论证，鉴定，评估，评估，检查费，知识产权申请费，注册费，代理费，差旅费，会议费费用等因此，与研发活动直接相关的差旅费和会议费可以按照规定标准之内的研发费用扣除（不超过可抵扣研发费用总额的10％）。
误解四：计算与研发活动直接相关的其他费用，扣除基数上限而没有其他费用
财税〔2015〕119号规定，可抵扣研发费用的合计扣除额，不得超过研发费用的10％。
因此，与研发活动直接相关的其他费用的抵扣限额为“可抵扣研发费用总额”的10％，“可抵扣研发费用总额”应包括“与研发活动直接相关的其他费用”。研发活动”需要提醒的是，“研发费用总额扣除”中的“与研发活动直接相关的其他费用”也在标准之内，并不等于实际发生的情况。
误区五：享受加速折旧政策无法享受研发费用加扣除
财税〔2015〕119号规定，用于R＆D活动的仪器设备的折旧可根据R＆D费用扣除。
如果企业用于研发活动的仪器和设备已享受加速折旧政策，则在享受额外的研发费用减免时，应将已计入的折旧和费用处理为按照有关文件的规定额外扣除研发费用。该金额被扣除。
因此，对于从事研发活动的公司，这意味着按照会计公告的规定进行加速折旧处理的折旧和费用，如果满足附加扣除条件，仍可以享受额外扣除，并享受双倍优惠优惠。
误区6：只有高科技企业才能享受额外的研发费用减免
根据《企业所得税法》及其实施条例的规定，计算应纳税所得额时可以扣除企业用于开发新技术，新产品和新工艺的研发支出。财税[2015] 119号文件规定，该标准适用于会计核算健全，实施审计收款，能够准确收集研发费用的居民企业。
理解以上规定，《企业所得税法》的规定及其实施细则的有关文件不仅限于高新技术企业可以享受，还仅限于“适用于合理会计，实施审计收集和准确收集“用于研发的居民企业”，即非高新技术企业可享受研发费用的额外抵扣。
误区7：小型和微型企业无法享受额外减免研发费用的优惠政策
财税〔2015〕119号规定，本办法适用于财务会计核算正确，研发费用收缴情况准确的居民企业。此外，《财政部和国家税务总局关于实施企业所得税优惠政策若干问题的通知》（财税[2009] 69号）第二条规定，《企业所得税法》规定的各项税收优惠。企业所得税法及其实施细则如果规定了条件，则可以同时享受。
因此，即使企业已经享受减半的小规模半赢利企业，只要企业符合规定的条件，也可以同时享受《企业所得税法》及其实施条例中规定的各种税收优惠。应税收入和以20％的税率征收或减半的优惠政策也可以与研究开发费加减税措施相结合。
误区八：可以从非应税收入中扣除费用
财税〔2011〕70号规定：非应税收入用于支出形成的支出，计算应纳税所得额时不得扣除；计算支出形成的资产的折旧和摊销在计算应纳税所得额时不能扣除。
之后，另一家企业将符合本通知第1条规定的条件的金融资金视为非应税收入，则在5年（60个月）内未发生任何支出，也未还款给财务部门或其他分配的资金。在获得资金的第六年，应将政府部门的部分计入应纳税所得额；计算应纳税所得额时，应扣除应纳税所得额总额中所包含的财政资金支出。”
根据上述文件，如果企业计算了5年内未发生支出且未还给财务部门或其他政府部门分配的总收入资金的总收入部分，则应税收入总额中财政资金的产生情况研究可以按照《实施条例》第九十五条的有关规定扣除开发费。除上述情况外，企业不收取新产品研发的应税所得。
应当提醒您的是，考虑到还可以扣除非应税收入构成的支出，企业在实践中必须对收入是否属于“非应税收入”做出很好的选择。例如，符合条件的软件公司收到的增值税或退税被记为非应税收入，相应的非应税收入用于支出形成的支出。对于软件产品的研发以及复制和会计的扩展，公司可以“不计入应纳税所得额”的方式申请研发费用的优惠，而不可计入支出的非应纳税所得额为税前，和不允许在研发费用中扣除加计扣除，即企业享受由软件产品退还的税款即刻退税政策，用于软件产品研发的，不能享受加减政策。如果企业享受额外的扣除政策，那么它比“将增值税退税作为非应税收入进行会计处理”更“经济实惠”。
误区9：可以扣除从事研发活动人员的福利补贴
财税〔2015〕119号规定，直接雇用人员的工资，基本养老保险费，基本医疗保险费，失业保险费，工伤保险费，生育保险费和住房公积金在研发活动和外部就业中研发人员的人工成本。允许额外扣除研发费用。
国家税务总局2015年第34号公告规定，按照《国家税务总局关于减公司工资和员工福利”《中华人民共和国通知》（国税函〔2009〕3号）第一条可以按照公司的规定在税前扣除，作为企业的工资支出。
根据上述文件的规定，直接从事研发活动的员工已包括在公司的薪资和薪金体系中，并且以薪金和薪水固定的福利补贴可以视为薪水和工资。企业发生的工资支出，按照规定扣除税前费用。昨晚的研发费用也可以扣除。