根据原规定，预售期应预缴企业所得税=预售开发产品收入×估计营业利润率×所得税率；根据新规定，应预缴企业所得税=（预售开发产品收入×估算的应税毛利率-扣除标准调整期支出后的营业税，城建税，教育附加费，土地增值税）×所得税率。
《跨区域经营企业应纳税所得额征收管理暂行办法》第十六条规定：总行，分行位于税率不同的地区，总行应首先计算出应纳税所得额。统一的方式，然后遵循第19种方法第三条规定的比例和第二十三条规定的三个因素及其权重，在计算出不同税率的地区性机构的应纳税所得额之后，根据总公司所在地适用的税率计算应纳税额，分行
您提到的多缴税款，税务机关原则上不退还税款，而是扣减税款。