是。
财政部国家税务总局财税字（94）074号文件规定：企业免征或退还营业税（包括立即退税，首次退税），但国务院，财政部另有规定的除外财政部和国家税务总局除具有特定目的的项目外，应将其纳入企业利润，并按规定征收企业所得税。因此，首先征收的增值税然后作为补贴收入退还的增值税应缴纳企业所得税。
可以申请退款，但是公司所得税每天将收取5 / 10,000的滞纳金。
补充：
1.企业所得税被误缴为个人所得税，您可以根据《税收管理法》第51条申请退款：纳税额超过应纳税额的纳税人应在税后立即退还权威找到它；纳税如果某人在清算和缴纳税款之日起三年内发现，可以要求税务机关退还多缴的税款，并在同一时期增加银行存款的利息。税务机关应及时核对保证金，并及时退还；1.应退还关于国库管理的行政法规的规定。
2.根据《税收管理法》第32条的规定，企业所得税未到付款截止日期，需要支付滞纳金：如果纳税人未在规定的期限内缴纳税款，则扣缴义务人未缴纳在规定的期限内缴税除缴纳税款外，税务机关除在限期内责令限期缴纳外，还应自滞纳税之日起加收滞纳金的五十分之一。