通常在年底扣除
根据国家税务总局关于建筑安装行业跨省和异地工程工人个人所得税征收和管理的公告，总承包企业和分包企业使用工资所得的个人劳动收入劳务派遣公司跨省和远程就业期间的工资和薪水。劳务派遣单位应当依法代扣代缴，并向项目所在地的税务机关申报代缴。
总承包企业，分包企业和劳务派遣公司所在的税务机关不得对不同地点的建筑工人赚取的应税工资和薪水重复征税。
扩展数据
除非税收法规另有规定，否则税前扣除的确认通常应遵循以下原则：
（1）权责发生制原则。也就是说，纳税人应在费用发生时而不是在实际支付时确认扣除额。
（2）匹配原理。也就是说，纳税人发生的费用应在费用匹配或分配期间报告并扣除。
纳税人在一个纳税年度应付的可扣减费用不能提前或延迟报告。
（3）关联性原则。也就是说，纳税人的可扣减费用必须与获得应课税收入的性质和来源有关。
（4）确定性原则。也就是说，每当支付纳税人的可抵扣费用时，都必须确定金额。
（5）合理性原则。也就是说，纳税人可抵扣费用的计算和分配方法应符合一般业务惯例和会计惯例。
根据国税函[2010] 156号《关于跨区域建筑企业所得税征收管理有关问题的通知》：由建筑企业总部直接管理的跨区域项目部门以0.2为基础。项目实际营业收入的百分比总公司或每季度按季度将公司所得税预分配给项目所在地，项目部门应提前向当地主管税务机关缴纳。
建筑企业总公司应按照下列方法计算企业应缴纳的所得税总额并预缴：
（1）如果总部只有一个跨地区的项目部门，则在扣除项目部门预付的企业所得税后，将根据其余额当场支付；
（2）总部只有两个分支机构的，应按照国税发[2008] 28号的规定计算总部和分支机构的应纳税额；
（3）如果总公司既有跨地区项目部门直接管理，又有跨地区二级分支机构，则应先扣除项目部门预缴的企业所得税，然后按照国税[2008] 28号文件编号规定了总公司和分支机构应缴税款的计算方式。
文件进一步规定，建筑企业总部应按有关规定办理企业所得税的年度结算和清算，分支机构和项目部门不得进行结算。当总部的年终最终所得税的支付额少于预付税额时，总部的税务机关应对退税额进行处理或扣除下一年应缴纳的企业所得税。
国家税务总局关于跨地区建筑企业所得税征收管理有关问题的通知
国税函[2010] 156号
省，自治区，中央直辖市以及计划分立的城市的国家税务局和地方税务局：
为了加强对跨地区（指省，自治区，中央直辖市和计划分开的城市的经营企业）的所得税的征收和管理，根据以下规定： 《中华人民共和国企业所得税法》及其实施规定，《中华人民共和国《共和国税收征收管理法》及其实施细则，以及《国家税务总局关于印发〈区域性营业税缴纳企业所得税征收管理暂行办法〉的通知》（国税发〔2008〕28号）。关于建筑施工企业所得税征收管理问题的通知如下：
1.实行一般分支机构制度的跨地区建筑企业，应严格按照国税发[2008] 28号的规定，按照“统一计算，分级管理，现场预付款，简易清算，仓库的财务调整”计算并缴纳企业所得税。
其次，由建筑企业下属的第二级或下级分支机构直接管理的项目部门（包括与项目部门性质相同的项目总部和合同部门，下同）不现场缴纳企业所得税。营业收入，职工工资和总资产应当汇总到二级分行进行统一核算，二级分行应按照国税发[2008] 28号文件的规定预先缴纳企业所得税。 。
3.由建筑企业总部直接管理的跨区域项目部门，应由总部每月或每季度按实际费用的0.2％预分配公司所得税到项目所在地。项目营业收入当地主管税务机关预先付款。
IV。建筑企业总部应当计算企业应缴纳的所得税总额，并按照以下方式预缴：
（1）如果总部只有一个跨地区的项目部门，则在扣除项目部门预缴的企业所得税后，将根据其余额在本地支付；
（3）如果总公司既有直接管理的跨地区项目部门又有跨地区第二级分支机构，则应先扣除由项目部门预付的企业所得税，然后在按照国税[2008] 28号文件编号规定了总公司和分支机构应缴税款的计算方式。
五，建设企业总部应当按照有关规定办理企业所得税的年度结算和清算，分支机构和项目部门不得进行结算。当总部的年终最终所得税的支付额少于预付税额时，总部的税务机关应对退税额进行处理或扣除下一年应缴纳的企业所得税。
六。跨区域运营的项目部门（包括由第二级以下分支机构管理的项目部门）应向项目主管税务机关颁发项目所在地主管税务机关签发的《对外经营活动税收管理证书》。项目的位置。如果提供了上述证明，项目部门所在地的主管税务机关应督促其补正期限；无法提供上述证明的，应当作为独立纳税人现场缴纳企业所得税。同时，项目部门应向地方税务主管部门提供总行出具的证明文件，证明项目部门属于总行或二级分支机构的管理部门。