企业以现金方式支付给个人的住房补贴和医疗补贴，应当全部计入接受者当期的工资和薪金所得，并按个人所得税缴纳。
财税字[1997] 144号文规定，对参与改革的住房公积金，医疗保险基金和养老保险基金征收个人所得税，具体如下：
企业以现金方式支付给个人的住房补贴和医疗补贴，应全部计入接受者的当期工资，其工资收入应缴纳个人所得税。但是，外国人以实际报销和报销的形式获得的住房补贴，仍将按照财政部和国家税务总局公告的规定暂时免征个人所得税。关于个人所得税政策的问题（财税字[1994] 020号）。
另外：根据《北京市地方税务局关于澄清与个人所得税有关的业务政策问题的通知》，京地水阁[2002] 597号：建设部，国家计委，财政部，人民银行和国务院机构事务管理局，建设银行，中国直接管理局和北京市人民政府《关于进一步深化北京市中央和国家机关住房制度改革的实施方案》的规定，住房补贴标准为个人从单位取得的个人暂免征税所得税，超过标准的部分计入月薪以计算税额。
1.《关于因公务用车制度改革而个人获得补贴收入征收个人所得税的通知》（国税函〔2006〕245号）规定，因公务员制度改革而产生的收入汽车使用系统，个人雇员应以现金和报销的形式支付该收入应视为来自公务车补贴的个人收入，个人所得税应按“工资和薪金收入”项目计算。
具体的计算方法基于《国家税务总局关于个人所得税政策问题的通知》（国税发〔1999〕058号）第二条，“关于个人取得公务运输和通讯补贴”相关规定得到执行。
《国家税务总局关于个人所得税有关政策问题的通知》（国税发〔1999〕058号），关于个人取得官方交通运输和通信补贴收入的税收问题的第二条通过通讯系统改革获得的公务用车和通讯补贴收入，在扣除一定标准的公务支出后，应根据“工资和薪金”中的项目，缴纳个人所得税。个人所得税按月支付，个人所得税按当月“工资和薪金”的收入计算；如果不按月支付，则将其分解为该月，并与该月的“薪金和工资”收入相结合。公务费扣除标准，是由省地方税务局根据纳税人公务交通支出的实际发生额计算的，报省人民政府批准，报国家税务总局备案。
根据以上两个文件的规定，我们了解到，公司在支付个人“汽车补偿金”时，必须扣除一定标准的公务费用，并根据“工资和薪金税”中的项目计算个人所得税。薪水”。
这里的“扣除一定标准的公务费用”通常由税务机关在各地以文件形式进行规定，例如：吉林省地方税务局《关于印发个人所得税的通知》。个人获得的税收改革补贴收入”》（吉地水发〔2007〕69号）。
“三，个人从符合前两个规定要求的单位获得公务车制度改革的补贴收入（以下简称补贴收入），公务费用扣除标准为：长春，吉林市临时每人每月暂定为2500元，其他城市（县）暂定为2000元，县（市）暂定为1500元。补贴收入低于上述扣除标准的，在扣除个人所得税前扣除；如果超过扣除标准，超出部分将被合并对当月的工资收入征收个人所得税。 ”
如果贵公司所在地的税务机关目前没有相关规定，我们认为员工获得的“汽车补偿金”应按照国税函规定的现金，报销等方式支付给员工[2006] 245收入应视为根据工资和薪金所得的个人从公务车补贴中获得的收入。