个人所得税法规定，公积金和社会保险均应在所得税前扣除。
也就是说，已缴纳的个人所得税金额是所有工资收入减去个人缴纳的社会保障和公积金的金额。因此，公积金完全免税，不用缴税，但是公积金在所有地方都有上限，不可能为所有收入支付公积金。通常，在每个地方或企业中，工资的8％，10％或12％这三个比率并不完全相同，并且可以满足这三个比率。
公积金贷款的还款不能从个人所得税中扣除。根据《地方税务局关于个人缴纳住房公积金贷款利息免征个人所得税有关问题的通知》：
首先，个人支付的住房公积金贷款利息可以从每月个人工资和薪金的应税收入中扣除，并且免征个人所得税，但是住房公积金本金和其他个人支付的款项住房贷款（如抵押贷款）形式的本息，不得从应税所得中扣除，并应按规定征收个人所得税。
其次，当每个单位的会计部门每月预扣个人所得税时，使用住房公积金贷款购买房屋的个人必须要求他们提供由每个州和县分支机构盖章的“现金收据”。上个月的天津建设银行原始的“天津职工个人住房贷款还款查询表”用作抵扣个人所得税的凭证。会计部门应按照有关规定保存该凭证，并在每月申报税收时附上上述凭证的副本。审查上述凭证，并按规定收取个人所得税。