运输公司的企业所得税应通过审计收取。如果帐户混乱，并且难以检查帐户，则税务机关可以核实收款情况。
运输行业企业所得税的目的是运输收入和运输行业纳税人获得的其他收入。
基本计算公式：应税收入=总收入-可扣除项目的金额，应税收入=应税收入×税率。
运输行业的企业所得税通常每季度预缴一次。
根据国家税务总局印发（企业所得税征收征收办法）（试行）的通知（国税发〔2008〕030号）：
如果使用应税所得税率来批准企业所得税的征收，则应纳税额的计算公式如下：
应付所得税=应纳税所得额×适用税率
应税收入=应税收入×应税收入率