一次性住房补贴的个人所得税应全部计入当期工资和受款人的工资收入，计算个人所得税。
根据《财政部国家税务总局关于征收医疗公积金和住房公积金养老金的个人所得税的通知》（财税资[1997] 144号），以现金向个人提供住房补贴，医疗补助费应全额计入接收者的当期工资和工资收入，并应缴纳个人所得税。但是，根据《财政部和国家税务总局关于若干问题的通知》的规定，外国个人以实际报销和报销的形式获得的住房补贴仍暂时免征个人所得税。关于个人所得税政策（财税字第（94）20号）。
根据财政部国家税务总局财税字[1997] 144号文件《关于住房公积金医疗保险基金和养老保险基金征收个人所得税有关问题的通知》：企业以现金形式支付给个人的补贴和医疗补贴；个人所得税应按收款人当期工资和薪金所得全额计算和征收。 ”
因此，根据“住房公积金管理条例”和“建设部，财政部和中国人民银行关于中国住房建设若干具体问题的指导意见”的精神， 《住房公积金管理》（建政〔2005〕5号），您实际上，公司没有为“住房公积金”支付特别账户，应将其视为现金支付形式，并应计入当月薪水和缴纳个人所得税。
财政部国家税务总局
关于征收住房公积金，医疗保险基金，养老保险基金的个人所得税的通知
发行日期：1997-11-07发行编号：财税字[1997] 144号
省，自治区，中央直辖市，有单独计划的市以及地方税务局：
根据国务院的统一部署，各地陆续发布了住房制度，医疗保险制度和养老保险制度改革实施方案。关于改革体系中的住房公积金，医疗保险基金和养老保险基金征收个人所得税的通知如下：
1.企业和个人提取住房公积金，医疗保险基金和基本养老保险基金，这些住房公积金，医疗保险基金和基本养老保险基金是按照国家或地方政府法规的比例实际提取并支付给指定金融机构的，个人当前的工资和工资收入。免征个人所得税。对于超过国家或地方政府规定缴纳的住房公积金，医疗保险基金和基本养老保险，应将超出部分计入个人的当期工资和工资收入，并计算个人所得税。（根据《财政部和国家税务总局关于基本养老保险金，基本医疗保险金，失业保险金和住房公积金有关个人所得税政策的通知》，财税[2006] 10，自2006年6月27日起废除。）
2.个人获得住房公积金，医疗保险和基本养老保险后，免征个人所得税。（根据国家财政总局财政部基本养老保险基本医疗保险保费失业...
2.个人获得住房公积金，医疗保险和基本养老保险后，免征个人所得税。（根据《财政部和国家税务总局关于基本养老保险金，基本医疗保险金，失业保险金和住房公积金有关个人所得税政策的通知》，财税[2006] 10，自2006年6月27日起废除。）
3.企业以现金形式支付给个人的住房补贴和医疗补贴，应全部计入接受者的当期工资和薪金，并按个人所得税征收。但是，按照《财政部，国家税务总局关于部分财政收入的通知》的规定，外国个人以实际报销和报销的方式获得的住房补贴仍暂时免征个人所得税。 《关于个人所得税的政策问题》（财税字〔1994〕20号）。
4.本通知自1998年1月1日起实施。原始的政策法规与本通知有抵触，应按照本通知执行。
从上述文件的精神可以看出，贵公司向员工发放的一次性住房补贴应按所支付金额确定的税率缴纳个人所得税。