电子商务对中国税收制度的影响：
（1）缺乏征税和管理所需的证据会增加税收损失的风险。
电子商务使用系统的电子技术来改变原始的纸币流，货币流，甚至将人们的流动转化为“电子”流。传统业务活动必需的纸质合同，票据，货物付款以及企业和资本账户，已经成为互联网上短暂的电子信息流，并且相关的销售基础和凭证以电子信息的形式传输。电子商务的这种无纸化经营客观上使收税管理失去了最直接的基础。网上交易资料的隐蔽性和保密性使税务机关无法跟踪，掌握，审计和监视运营商的交易状况，从而在电子商务领域形成了一个“盲区”来进行税收征收管理。因为企业可以直接在Internet上进行交易而不必通过中介机构，所以这也使得传统的预扣和纳税方式变得不可能。
同时，电子商务活动是建立在虚拟市场上的，在线交易没有明显的“场所”，“基地”或人员“退出”，从而使传统的经济模式成为永久性机构，商业活动的地点等待概念变得模棱两可。此外，传统的税收制度规定，从事生产，销售或提供劳务和服务的单位和个人必须经过税务登记。税务登记是税务机关管理纳税人，了解纳税来源状况的基本手段，是建立法律关系的基础和证明。但是，电子商务自问世以来就没有对此给予太多关注。任何支付一定注册费的企业都可以获取自己的专用域名，并可以在Internet上从事商业活动和信息交换。所有这些使收集应征收的税收变得困难，导致税收的浪费。
（2）电子商务使得很难确定税收管辖范围。
目前，世界上大多数国家/地区具有平行的地区管辖权和居民管辖权，因此产生的国际双重征税通常以双边税收协定的形式解决。但是，互联网交易中税收管辖权的确定受到了挑战。例如，常设机构很难确定。 “常设机构”是指企业进行全部或部分业务活动的固定场所。只有在一个国家/地区建立常设机构并获得属于该常设机构的收入，才可以将其视为从该国家/地区获得，并且该国家/地区享有领土管辖权。在在线世界中，可以买卖的网络地址或服务器是否被视为“常设机构”？假设所涉及的管理和销售系统位于不同的国家，应如何确定法人常设机构的所在地？如何判断法人的居民身份？这一切都影响到税收管辖权的建立，而且这个问题也容易导致各国之间发生争端，从而导致新的国际税收争端。
（3）税务审计变得更加困难。
各国的税法通常规定，纳税人必须忠实地保留帐户，并保留账簿，会计凭证和其他与税收有关的信息，以供税务机关检查数年，这规定了该法律必须遵循帐户凭证为税收集和管理的基础。电子商务的隐蔽性和保密性导致失去了传统的凭证跟踪审计的基础。电子商务出现并以电子数据信息材料的形式传输。电子数据信息材料随时都有被修改或删除的风险。无法准确确定数字图章和签名的唯一性和机密性。随着计算机加密技术的发展，纳税人可以利用加密技术掩盖相关信息，使税务机关无法获得真实，充分的信息。政府的管理信息未能控制扣缴税款来源的手段，客观上促使纳税人任意遵守税法，导致税收损失。增加了税务审计的难度。
（4）国际避税问题日益严重。
互联网在全球范围内为公司和消费者提供了直接交易机会，这削弱了中介机构的作用，从而削弱了中介机构预扣税的作用。为了降低成本，逃税和电子数据交换技术的多种应用，跨国集团已使企业集团高度集成。企业通过互联网在全球范围内“合理地”分配产品开发，设计，生产和销售将变得容易。在避税天堂建立基地公司也很容易，高税区的利润可以很容易地通过互联网转移到低税区或避税区。
电子商务是随着信息技术的飞速发展而出现的一种全新的商品流通形式。信息内容，整合的信息资源，商业交易和合作交流是这种形式的基本含义。计算机网络（主要是Internet）是要实现此表单的基本支持。电子商务作为一种新的商业活动形式，将带来前所未有的革命，其影响远远超过了商业活动本身。电子商务不仅是一种新的销售渠道或一种新的业务运作方式，还是知识经济运作和发展的最佳方式。代表了贸易的未来发展方向；它会影响一个国家在未来全球经济和技术竞争中的地位和作用，并将影响人类社会的生产和运作，人们的生活和就业，政府职能，法制和文化教育。各方面都会带来非常深刻的影响。
税收作为国家实现其职能并获得主要财政收入的基本形式，也已受到电子商务的深刻影响。
1.电子商务加剧了避税问题
（1）避税的原因
避税和反避税一直是税收工作中的主要问题。避税是指纳税人采用不合法的方法。在税法允许的范围内，通过安排业务和金融活动，可以达到避免或减轻税收负担的目的。避税的原因可以分为主观和客观原因：
1个主观原因：对于纳税人而言，无论纳税多少公平合理，都意味着纳税人的直接经济利益受到损失。受到这种物质利益的刺激，纳税人将采取各种手段来避税，减轻税收负担并实现利润最大化。
2客观原因：主要原因是国家和地区之间的税收差异，例如国家行使的税收管辖权差异，国家的税收结构和税收负担差异，国家的税收减免制度，税收优惠政策差异等。由于存在这些差异，纳税人可以使用居住，收入和财产的转移以及通过国际避税天堂来实现避税。
（2）电子商务进行税收转移
目前，国家/地区的税制差异很大，即使在同一国家/地区的不同地区也存在一定差异。在传统的贸易方式下，跨区域和跨境产品的买卖仍占整个贸易的有限比例和份额，而在线交易则打破了各个地区和国家的局面。
对于企业而言，他们将涌向税负较低的国家和地区，并建立网站在此开展业务以达到减轻税负的目的；对于高税率国家或地区的消费者，他们将促使他们通过互联网从税率低的国家或地区购买商品，这不可避免地带来了税收转移。
尽管在中国征收什么税率和税率，但它们完全由国家税务总局制定。地方政府没有税收立法权，但是当前的税收任务仍然是通过自上而下的计划分配方法来执行的。除了不同地区不同的财政优惠政策外，在线贸易还可能带来新的税收转移问题。
（3）电子商务加剧了国际税收管辖权的冲突
电子商务的出现打破了传统的地域分隔，商业交易不再具有地域界限，但是税收也必须由特定的国家实体征收，并且这些实体必须在各自的特定领域缴税。利益存在差异。在无国界的免费网络空间中，互联网用户非常机动且隐蔽，税务机关很难跟踪和确定服务的位置以及产品的使用，从而导致无法开始收税。
随着现代技术的发展和电子商务的成熟，公司将更容易根据自己的需求选择交易的地点，这将导致交易活动普遍转移到税收较弱的地区管辖权。
（4）互联网为纳税人提供了避税的高科技手段
Internet的全球性，无边界和高科技性质不仅为公司提供了最大化利润的手段，而且还增加了避税的可能性。