食品加工企业按国家税（税率25％）缴纳增值税和企业所得税。一般纳税人的增值税率为17％，小规模纳税人的增值税率为3％。
地方税：城市维护建设税和教育附加费，税率分别为增值税的7％和4％。
【企业所得税负担率算法】
所得税税率是所支付的年度所得税占公司销售或营业额的百分比。企业所得税税率的计算公式为应纳税所得额除以营业收入。
计算公司所得税负担率=应付所得税÷销售×100％。税负是指实际应交税额占相应应税销售收入的比例。税负可以指增值税，所得税，营业税等。也可以将今年已缴纳的所有税费加起来以计算总体税负。税收负担有三种形式：比例，累进和回归。比例税负是负纳税人的应纳税额与其收入之比不随收入的变化而变化。累进税负是负纳税人的税负与其收入之比随收入增加而增加的比率；纳税人的税负是负纳税人所负担的税额与其收入之比随收入的增加而减少。
各行业企业所得税预警税率的参考：
1个餐饮业2.00％
2公路运输业2.00％
3电力和热力生产和供应1.50％
4机电设备制造2.00％
5房地产4.00％
6纺织服装，鞋帽制造业1.00％
7纺织业1.00％
8纺织业-袜子业1.00％
9非金属矿物制品业1.00％
10废物资源和废料回收和加工行业1.50％
11手工业及其他制造业1.50％
12手工艺品和其他制造珍珠4.00％
13化工原料和化工产品制造业2.00％
14计算机服务行业2.00％
15家具制造业1.50％
16建筑安装行业1.50％
17建材制造业3.00％
18建筑材料制造-水泥2.00％
19金属制品业2.00％
20个金属制品行业-春季3.00％
21金属制品业-轴承6.00％
22居民服务业1.20％
23零售1.50％
24木材加工及木材，竹，藤，棕榈，稻草制品业1.00％
25农业，林业，畜牧业和渔业服务1.10％
26农副食品加工业1.00％
27批发1.00％
28皮革，毛皮，羽毛（羽绒）及其制品1.00％
29其他采矿业1.00％
30其他服务4.00％
31其他建筑行业1.50％
32其他制造业1.50％
33其他制造业-管道行业3.00％
34其他制造业-热水管件1.00％
35商业服务业2.50％
36食品制造业1.00％
37塑料制品行业3.00％
38通讯设备，计算机和其他电子设备制造业2.00％
39通用设备制造业2.00％
40家畜1.20
41制药业2.50％
42饮料制造2.00％
43印刷业和记录媒体的复制1.00％
44娱乐产业6.00％
45纸和纸制品业1.00％
46专业机械制造2.00％
47专业技术服务行业2.50％
增值税税负率=应纳税额/销售收入，即系统=（销项税-销项税）/销售收入×100
序列号行业平均税收负担率
1农业和副食品加工3.50
2餐饮4.50
3纺织品（化学纤维）2.25
4纺织服装，皮革羽毛（羽绒）和产品2.91
5纸和纸制品业5.00
6建材产品4.98
7化工产品3.35
8制药业8.50
9卷烟加工12.50
10塑料制品业3.50
11非金属矿物制品业5.50
12金属制品业2.20
13机械运输设备3.70
14电子通讯设备2.65
15工艺品及其他制造业3.50
16电气机械和设备3.70
17电力和热力生产和供应4.95
18商业批发0.90
19商业零售2.50
20其他3.50
税负税率是指增值税纳税人应缴的当期增值税在当期应税销售收入中所占的比例。
企业税收负担率的计算与分析
税负负担率的变化= [该地区（或上一年同期）同一行业的企业税负负担率-平均税负负担率]÷同一行业的本地平均税负负担率（或上年同期比率）×100
将测得的企业税负税率与去年同期，同一行业的平均税负税率进行比较，如果税负税率差小于-30，则企业宣布异常。
（2）公司销售变化率的计算和分析
当月应税销售额的变化率=（（当月应税销售额上个月的应税销售额）÷前一个月应税销售额×100
累计应税销售额变化率=（当期累计应税销售额-去年同期应税销售额）÷去年同期应税销售额×100
当月的累计应税销售额变化率或应税销售额变化率超过50或小于-50。应分析应纳税所得额和应纳税额，以匹配企业申报是否异常。
（3）销售成本变化率与销售变化率的匹配分析
销售成本变动率=（当期累计销售成本-去年同期累计销售成本）÷去年同期累计销售成本×100
销售变化率=（当期累计销售量-去年同期累计销售量）÷去年同期累计销售量×100
公司销售成本的变化率与销售率的变化率之差=销售成本的变化率-销售的变化率
如果销售成本的变化率与销售的变化率之差超过每个地点设定的正常峰值，则该公司声明异常。
（4）企业零负申报的异常情况分析（考虑剩余税收抵免的增加比例）
（五）进项税的构成分析
进项税额的比例=当期非增值税发票扣除凭证进项税额÷当期已扣除的进项税总额×100
如果通过上述公式计算的结果连续两个月大于60（特殊行业除外），则企业声明为异常。
（6）分析已开立的增值税发票金额的变化
特殊发票金额的变动率=当前期间的特殊发票金额÷上期的特殊发票金额×100
如果根据上述公式计算得出的结果大于1.5或小于0.5，则企业声明异常。
对于小规模纳税人，税负税率是征收率：企业4，行业6，对于一般纳税人，由于可以抵扣进项税，因此税负税率不是17或13，而远低于这个比例，具体计算：
税负税率=当期应交增值税/当期应税销售收入
当前应交增值税=当前销项税-进项税的实际扣除额
实际扣减的进项税额=期初剩余的初始进项税额-本期末的进项税额-期末剩余的进项税额的进项转出出口退税额-