污水处理企业不缴纳增值税，营业税，企业所得税按规定税率缴纳。2007年《新企业所得税法》第27条规定，从事环保，节能，节水项目的企业收入可以免征或减少。实施细则明确规定，从事公共污水处理，公共废物处理，沼气综合开发利用，节能减排技术改造，海水淡化等项目的企业，从纳税年度起计收入。获得项目的第一笔生产和经营收入。三个豁免和三个一半。
从事合格的环境保护，节能和节水项目的收入可以免征或减少企业所得税。
根据《中华人民共和国企业所得税法实施条例》（中华人民共和国国务院第512号令），其中提到了合格的环境保护和节能措施企业所得税法第二十七条第三款节水项目，包括公共污水处理，公共废物处理，沼气综合开发利用，节能减排技术改造，海水淡化等。项目的具体条件和范围，由国务院财税部门与国务院有关部门协商制定，并报国务院批准后公布实施。
从事前款规定的合格的环境保护，节能和节水项目的企业的收入，从该项目获得的纳税年度的第一年到第三年免征企业所得税。第一生产经营收入。企业所得税将从四年减半至第六年。
污水处理业务属于增值税应税项目，但根据财税[2008] 156号文件，符合标准的污水处理服务免征增值税。相应地，免征增值税项目的进项税额也不能扣除。
污水处理费是根据补偿排污管道和污水处理设施的运营和维护成本并合理获利的原则批准的。污水处理费的税种，是从事符合条件的环境保护项目的收入。自获得项目第一笔生产经营收入的纳税年度起，从第一年至第三年，第四年至第六年免征企业所得税公司所得税每年减半。污水处理费通行者与付款人具有合同关系或委托关系。
通常，污水处理费包含在水费中。水费包括基本水费，城市附加费，水资源费，污水处理费，南水北调资金，水厂建设费和省专项费。（组成根据省市收费而有所不同）
同时根据《中华人民共和国增值税暂行条例》（国务院令2008年第538号）
第10条规定，用于免征增值税的商品或应税服务的购买进项税，不应从销项税中扣除。
财税〔2013〕23号规定，纳税人在办理增值税退税，资源综合利用产品和劳务免税时，还应当提交污染物排放地环境保护部门确定的污染物排放量，以实现污染物排放。服务纳税人的污染物排放达到上述标准的前六个月内排放污染物的场所的标准以及环境保护部门发布的证明材料。在已经进行环境保护验证的行业中，符合环境保护部门发布的符合环境保护法律，法规要求的企业名单的公告，应当作为证明材料。可见，污水处理达标后才能享受免征增值税的政策。
《企业所得税法》及其实施条例规定，污水处理企业可享受三种所得税优惠：第一，减免税，从事环保，节能节水项目的企业的收入，从项目中获得的第一笔款项从生产经营收入所属的纳税年度起，享受“三免三减”。二是降低收入偏好。企业以《企业所得税优惠综合目录》规定的资源为主要原料，生产符合国家有关标准和行业标准的该国非限制性和违禁产品所获得的收入。总收入。第三是税收抵免优惠。如果企业购买并实际使用了《节能节水设备企业所得税优惠目录》中规定的节能节水专用设备，该专用设备的投资应从应纳税额中扣除10％。信用;如果当前年度不足，则可以在接下来的5个纳税年度结转抵免额。
值得注意的是，《国家税务总局关于行政审批事项及有关工作披露的公告》（国家税务总局公告2014年第10号）包括了经批准的企业环境保护和节能工作。批准关于节水项目收入的所得税优惠的备案，以及批准投资购买环保，节能节水和安全生产的专用设备的企业的所得税优惠的备案。因此，上述投资者的新污水处理企业应事先向主管税务机关备案，以享受企业所得税的优惠待遇。