1.根据国家2011年颁布的《个人所得税法》，企业职工的个人所得税由所属单位代扣代缴。
2.公司财务部门代扣个人所得税时：
借款：应付职工薪酬
贷款：应付税款-应交个人所得税
3.付款时：
借：应交税款-应交个人所得税
贷款：银行存款
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区分两个概念。第一：企业支付给职工的工资（包括为取得企业工资而应支付给职工的个人所得税）是企业应承担的费用。例如，在您的示例中为100元。企业支付给职工的工资，应全部计入管理费用。在这个概念中，应该从公司的角度向员工支付工资，而不管员工是否必须纳税。条目如下：借入：管理费用100贷方：应付员工补偿100第二：在员工收到薪水100元后，如果达到纳税起征点，则必须向税务部门申报并缴纳个人所得税，如你所说例子是1元。如果企业不代表员工付款，则企业无需进行任何输入。员工收到后，将去税务局申报。
如果遵循上述过程，则会出现两个问题。一是收税工作很麻烦。企业中有1,000人，必须纳税500人。然后，税务部门必须面对500人。仅需纳税的工作量和审计量。2对于企业的员工来说非常麻烦，必须有500人用他们的工作时间向税务部门缴税。因此，为了简化征收程序，税务部门要求公司在支付工资时有义务代扣代缴。因此，企业向员工薪金分录支付100元。然后，在付款时只付了99元，又要求又付了1元，它直接提交给税务局以形成如下条目：计算工资时：借入：管理费用100贷款：应付给员工补偿100支付的工资：借：支付职工薪酬100贷款：银行存款99贷款：应纳税额1企业支付税时：借款：应纳税额1贷款：银行存款1
企业代扣代缴个人所得税。累计工资时，应同时计税。借方“应付职工薪酬”和贷方“应付税款（对应明细帐目）”不能直接计入管理费用，或信用存款；
通常需要先撤销与税收有关的会计业务，然后再进行声明和付款。当前的17种税收类型和几种税收法规的处理方式如下：
{1}增值税是一种减价税，其会计处理在确认销售收入后另行处理；
2）个人所得税由企业代扣代缴。在累计工资时，应同时计税，借方“应付职工薪酬”，贷方“应付税款（对应明细帐）”；
3）预扣营业税，消费税，资源税，城市土地使用税，房地产税，车辆和船舶税，矿产资源补偿费，排污费，借方“营业税和附加费”，贷方“应付税款” ”（对应详细帐目）”；
4）在计算增值税，营业税和消费税，借方“营业税和附加费”和借方“税费”时，应同时计算城市建设税，教育附加费和地方教育附加费。应付（相应的详细信息学科）”;
5）在娱乐业和广告业中缴纳营业税（以及营业改革和增加后的增值税）的单位和个人，应将文化事业的建设成本与营业税及借记“营业税”一并计入。和附加费”，贷方“应付税款（对应明细帐）”；
6）从事旅游经营活动的单位和个人，应按旅游营业额的5‰收取旅游促进费，借记“营业税金及附加”，贷记“应交税金”（对应于详细账目）“;
7）计算进口关税，借方“材料采购”和其他科目，以及贷记“应付税款（对应于详细科目）”科目；计算进口关税，借记“营业税及附加”科目，贷记“应付税款（对应于详细帐户）”帐户；
8）预扣公司所得税，借记“所得税费用”科目，贷记“应付税款（对应于详细帐目）”科目；
9）土地使用权转让应交纳的土地增值税，应按照无形资产或固定资产的转让，按照原会计账户进行处理，并从有关账户中扣除并入账。）“;
10）企业缴纳的契税和耕地占用税直接计入有关房屋和土地的成本，不通过“应付税款（对应明细账）”核算；
11）企业缴纳的印花税直接从“管理费用”帐户中扣除，贷记“银行存款”和其他科目，而没有通过“应税费用（对应于详细科目）”帐户；
12）车辆购置税直接计入相关车辆购置成本，借记“固定资产”帐户，贷记“银行存款”帐户，未通过“应税费用（对应到详细的帐户）”；
13）计提烟草税，“材料购买”和其他科目的借方，以及“应付税款（对应于详细科目）”科目的贷记；
14）撤消残疾人的就业保障，从“残疾人的管理费用-就业保障”项中扣除，并贷记“残疾人的应付税款-就业保障”；
15）缴税时，从“应付税款（对应明细帐）”帐户中扣除，并在“银行存款”帐户中贷记；
16）当企业收到退还的企业所得税，增值税（不包括出口退税），消费税，营业税等时，将从“银行存款”帐户中扣除，并在“营业外收入”。