对于股权变更，应当从相关费用和股本余额中扣除全部股权交易额，代扣代缴企业所得税，按照10％的税率计算。
如何确认股权交易金额取决于当地主管税务机关的交易判断和关联方交易的判断等因素。
纳税是公民的义务，而避税是非法的。对于自然人来说，转让有限责任公司股权的应纳税额通常可以采用以下方法；
1.有效利用知识产权和其他无形资产来避税。在转让股权之前，自然人股东将通过以自己的名义持有商标，专利或版权来预先增加公司的资本。因为评估价格是可控的，所以他们将大大增加自己的权益，并且能够尽量减少交易税的产生；
2.在股权转让前的某个时间（6个月至一年），通过增加坏账准备和其他财务安排等财务安排有效地减少了公司的净资产；
3.如果自然人股东仍然持有其他有限责任公司的100％，则他们可以通过商业交易，选择适当的交易和适用的税种来减少股权交易税的产生。
对于股权收购方，被收购企业支付的对价形式包括股权支付，非股权支付或两者的结合。其中，非股权支付是指公司证券，存货，固定资产，其他资产和承担债务的支付形式。非股权支付等于并购公司首先将非货币资产转移给被并购公司，然后使用通过转让获得的经济利益购买被并购公司的股权。因此，被收购企业的非股权支付涉及股权收购中的存货和固定资产时，被收购企业应当依法计算并缴纳增值税。购买者还必须根据“财产转让文件”，在已签署的股权转让协议上缴纳印花税。
对于股权转让方，股权转让不收取营业税。转让收入应在企业所得税中确认，但如果符合特殊税收处理规定，则在交易中未确认股权转让的转移支付或相关资产损失时，仍应当确认非股权支付。本期对应的资产转让损益，并调整相应资产的税基。如果发生股权投资损失，可以在特别声明资产损失后在税前扣除。您可以参考文章“重大税收相关事项-股权收购的运作3（1）！》有一张表，显示应缴纳什么税