可以按季度或按月进行预付款，应在年底后的五个月内进行结算和结算，并应补足退税。
的依据：《企业所得税法》第54条---企业所得税应按月或按季度预缴。
企业应在当月或季度结束后的15天内向税务机关提交预付的公司所得税申报表，并提前缴纳税款。
企业应在年底后的五个月内向税务机关提交年度公司所得税申报表，并结清并结清退税款。
企业在提交公司所得税申报表时，应按照规定附上财务和会计报告以及其他相关材料。
根据2010年第2号公告，《关于跨区域建筑施工企业所得税的征收和管理问题》：
1.本市其他省市的建筑业企业设立的项目部门（包括由二级以下分支机构管理的项目部门）可以提供由主管税务机关签发的《对外经营活动税收管理证书》。总部所在地的机关总公司出具的证明文件，证明项目部门属于总公司或二级分支机构管理部门的证明文件，应按发票金额的0.2％缴纳企业所得税。
在我市经营和设立分支机构的其他省市的建筑企业，只要符合二级分支机构的要求，并可以提供“企业所得税汇总税科分配表”，申报并缴纳企业所得税在注册地区或县的税务机关。
2.我市其他省市的建筑业企业设立的项目部门（包括第二级以下分支机构管理的项目部门）不能提供主管部门出具的《对外经营活动税收管理证书》。总公司所在地的税务机关。或总公司出具项目部属于总公司或二级分支机构的证明文件，应当以独立纳税人的名义现场缴纳企业所得税，并按8％的应纳税所得额缴纳。自2011年4月1日起的发票金额企业所得税是按发票金额的2％缴纳企业所得税。
在我市经营和设立分支机构的其他省市的建筑企业不符合二级分支机构的要求；尽管它们满足二级分支机构的要求，但是它们不能提供“企业所得税汇总税收分支机构分配表”从2011年4月1日起，将按发票金额的8％（即发票金额的2％）的应纳税所得额缴纳企业所得税。
公司所得税应在单位所在地的主管税务局缴纳。根据规定，施工企业应当向施工现场（场外）税务局缴纳增值税，城市建设税和教育附加费。所得税在建筑工地预缴，并在公司所在地结算。
法规
《国家税务总局关于建筑企业所得税征收管理有关问题的通知》（国税函〔2010〕39号），涉及跨地区经营。关于建筑施工企业所得税征收管理问题的通知如下：
1.实行一般，分事业单位制的跨地区经营建筑企业，应严格按照国税发〔2008〕28号的规定，按照“统一计算，分级管理，局部预付款，简易清算”的规定执行。和财务调整“计算和缴纳企业所得税的方法。
2.跨地区的建筑公司设立的不符合二级分支机构要求的项目管理部门（包括项目指挥部门和与项目经理部门性质相同的合同部门）应为：汇总到总部或二级分支机构组织按照国税发[2008] 28号文件的规定统一计算并计算和缴纳企业所得税。
3.地方税务机关违反本通知的收集和管理文件，应予以暂停和改正；未按规定收取企业所得税的，应当及时退回对于企业。未按照本通知要求进行更正的，国家税务总局将按照执法责任制的有关规定严肃处理。
《国家税务总局关于建筑业企业所得税征收管理有关问题的通知》（国税函〔2010〕39号）基本解决了目前异地建设企业收取企业所得税的问题。根据施工现场的征收率征税，对于全国的建筑公司来说，这是“好消息”。自从该文件于2010年1月26日发布以来，如果2009年的建筑业企业已在施工现场被地方税务机关征收了企业所得税，则它有权要求地方税务机关将其退还。