预付所得税总公司和分支机构应缴纳的所得税总额的100％，应由总部预付，其余50％应由分支机构预付。每个分支机构根据营业收入，员工薪酬和总资产来计算各自的分配比率，这三个因素的权重分别为0.35、0.35和0.3。
最终付款后，总部将计算公司全年的应纳税额，扣除预付款部分，计算退税额，并根据预付款比例在本地支付或退还税款。
根据国家税务总局印发公告（国家税务总局公告2012年第57号）：“总行第十三条总公司应按以下公式计算应纳税额：
总公司的税收评估=本期应纳税人的应交所得税×50％第14条分公司根据以下公式计算税收评估：
所有分支机构共享的总税费=纳税人当期应缴纳的总所得税×一个分支机构支付的税金的50％=所有分支机构共享的总税率×分支机构的比例根据营业收入，员工薪酬和上一年度分支机构总资产三个因素，计算各分支机构所占所得税的比例；对于第三级及以下分支机构，其营业收入，员工薪酬和总资产已包括在第二级分支机构中;这三个因子的权重依次为0.35、0.35和0.30。
计算如下：
分支机构的分配比率=（分支机构的营业收入/每个分支机构的营业收入的总和）×0.35 +（分支机构的雇员薪水/雇员的工资总额）每个分支）×0.35 +（分支总资产/所有分支机构的总资产）×0.30英寸。
公司所得税结算的扣除标准如下：
1.企业扣除的职工福利费用不超过工资总额的14％。
2.如果企业的工会经费不超过工资总额的2％，则不得扣除。
3.如果企业产生的员工教育支出不超过工资的2.5％，则不得扣除。
4.不能从年度利润的12％中扣除公共福利的扣除范围。
5.如果广告和企业促销费用不超过当年销售收入的15％，则不得扣除。
6.商业娱乐费是按已发生金额的60％扣除的。但最高不得超过当年销售收入的0.5％。
以上三项增加的费用应计入管理费。广告费和业务促销费的增加额应计入销售费，业务娱乐费应计入管理费。
扩展配置文件：
企业所得税税率是25％的比例税率。
最初的《企业所得税暂行条例》规定，企业所得税税率为33％，另外还有两种优惠税率。年应纳税所得额为30,000-100,000元的，税率为27％，应纳税所得额为3万元以下的税率为18％；经济特区和高新技术开发区高新技术企业的税率为15％。
外商投资企业的所得税率为30％，另加3％的地方所得税。新的所得税法规定法定税率为25％。内资企业和外资企业相同。国家需要15％的高科技企业，20％的小型和营利性企业以及20％的非居民企业。
应付企业所得税=当期应纳税所得额*适用税率
应税收入=总收入-允许扣除
公司所得税的税率是根据法定税率计算公司所得税的应纳税额。根据《中华人民共和国企业所得税暂行条例》的规定，2008年新的《中华人民共和国所得税法》规定，一般企业所得税税率为25％。
符合要求的小型且盈利的企业将按20％的减免税率缴纳企业所得税。
由国家税务总局发布的《关于国家税务总局关于小微企业优惠所得税政策问题的通知》（财税[2011] 117号），明确自2012年1月1日至12月31日。 ，2015年应纳税所得额不足6万元（含6万元）的小型盈利性企业，其所得应税所得额减少50％，并按20％的税率缴纳企业所得税。