1.申报增值税时，不含税。
2.从减免中转为营业外收入的部分应缴纳所得税。
3.如果将免税农产品的销售小范围地推广给一般纳税人：进项税将不被扣除，销项税将按照规定进行计算。
《中华人民共和国企业所得税法》第二十七条企业的下列所得可以免征或者减征企业所得税：
（1）从事农业，林业，畜牧业和渔业项目的收入； ...
如果您的公司是农业公司，则可以享受公司所得税减免税，如果您销售农产品，则不可避免地要缴纳公司所得税，因此必须正常申报并缴纳。
如果免税农产品的销售属于农业，林业，畜牧业和渔业，则必须将其提交给主管税务机关备案：“企业所得税优惠记录表”，加盖公章和法人的密封;同时，需要准备以下材料以进行保留：
1.有效期内远洋渔业企业资格证书（从事远洋渔业的人员）
2.选择农作物新品种的认证（用于农作物新品种的选择）；
3.与农民（具有“公司+农民”业务模式的企业）签订的委托农业合同；
4.与家庭承包商的内部合同合同（国有农场实施内部家庭合同管理）；
5.农产品初始加工项目和过程描述（两个或多个子项目描述）；
6.如果您同时从事采用不同企业所得税待遇的项目，则每年分别计算减税和免税项目收入的计算过程和相关书籍，其基础和期内合理成本分摊标准
7.省税务机关规定的其他材料。
的提交时间是在年终最终结算之前提交。详见国家税务总局2015年第76号公告。
该公司销售初级农产品，并根据不同的业务项目享受不同的所得税优惠：
《中华人民共和国企业所得税法》第86条《企业所得税法实施细则》可以免除企业所得税法第（1）条3.企业所得税减免是指：
（1）从事下列项目的企业的收入免征企业所得税：
1.种植蔬菜，谷物，土豆，油，豆，棉花，大麻，糖，水果，坚果
2.培育新的农作物品种；
3.中药材的栽培；
4.森林栽培和种植；
5.畜禽养殖；
6.收集林产品；
7.灌溉，农产品初级加工，兽药，农业技术推广，农业机械运行和维护等，农业，林业，畜牧业，渔业服务项目；
8.海洋捕鱼。
（2）从事下列项目的企业的收入，应减半征收企业所得税：
1.种植花卉，茶和其他饮料作物以及香料作物；
2.海洋水产养殖和内陆水产养殖。
从事受国家限制和禁止发展的项目的企业，不得享受本条规定的优惠企业所得税。