输入抵免额与应付企业所得税无关。
购置的固定资产计入管理费用，以计提折旧扣除公司所得税。
《所得税法》第11条在计算应纳税所得额时，应扣除企业按规定计算的固定资产折旧。
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您的两种方法都不正确，
而已。
如果税务机关未通过银行退还您的税款，则将从今年的税款中直接扣除。今年已缴税项为：
贷款：银行存款5000