出售店铺登记类别中非住宅房屋的主要税费如下：1.契税：房屋价格的百分之三，由买方支付；
2.营业税：5年后的差额为5.6％，少于5年的总差额的5.6％将由转让方（卖方）支付；
3.个人所得税：差额20％，由卖方支付；
4.土地增值税：由卖方支付的总额的3％。
可以避免这种情况，使合同价格尽可能低。
根据《土地增值税暂行条例》（国务院令第138号）第六条，计算增值税额的扣除项目为：（一）为取得土地使用权而支付的款项； （二）土地开发的成本费用；（三）新建房屋及辅助设施的成本或费用，或者旧房屋，建筑物的评估价； （四）与转让房地产有关的税费； （五）财政部规定的其他抵扣。《土地增值税规定实施细则》第七条第五款规定，与房地产转让有关的税款，是指转让房地产时所缴纳的营业税，城市维护建设税和印花税。因此，出售非住宅物业的个人在计算土地增值税时不能扣除个人所得税。
税收的收集和管理方法包括“支票收集”和“批准的收集”。
帐簿健全且有会计核算，您可以自己计算数据并定期申报税款；没有帐簿（只有一个正在运行的帐户，只知道您欠多少钱或谁欠您-这些不是财务部门和税务部门所需的帐户）他们还必须缴税，并必须批准收款。
通常，它适用于个体经营者（根据您的营业执照确定）。如果您的销售收入不符合指定的帐户，则必须每个月为您验证一个特定的销售收入编号。淘汰您每月必须支付的各种税款。通常需要将其银行卡号告知税务部门，税务部门会每月扣款。具体的税收类型包括增值税，城市建设税，教育费，印花税和个人所得税。