持有外国管理证书的企业只能扣除企业所得税。浙江省税务局扣除个人所得税是错误的。您只能支付的税款已包含在项目成本中，并抵消了应税收入。
如果是个体工商户的生产经营收入，而承包经营和租赁经营给企业事业单位的收入，则按照个人所得税法缴纳：
个人所得税税率表2（个体工商户的生产经营收入和企事业单位的承包经营和租赁经营所得）
系列应税年度税率（％）
1少于5000元5
（注：本表中的年度应纳税所得额是指根据本法第6条的规定，从每个纳税年度的总收入中扣除成本，费用和损失后的余额。）