新农合医疗保险是一项公益事业，不应征收所得税。所得税应仅支付给有利可图的业务部门。
没有必要。报销是公司的支出，与个人收入无关。
如果是雇员福利，应计入个人薪酬，超过税法规定的3500元，并缴纳个人所得税。
《中华人民共和国个人所得税法实施条例》第十四条规定了应纳税的免税福利，是指从企业，事业单位，国家机关和社会团体扣缴的福利费或工会经费。按照国家有关规定支付给个人的生活津贴。
《国家税务总局关于确定生活补助费范围的通知》（国税发〔1998〕155号）解释为：是指给予纳税人及其家庭的正常情况。由于某些特定事件或原因生活造成了一定的困难，他们任职的单位从按照国家规定保留的福利金或工会经费中向他们支付临时福利金。员工的医疗费用报销是否属于这种生活津贴，应当另行处理。
扩展数据
（1）省人民政府，国务院各部委和中国人民解放军之上的单位以及外国组织和国际组织，获得科学，教育，技术，文化，卫生，体育等奖项，环保等豁免征收个人所得税。
（2）设立乡（含乡）以上人民政府或者县（含县）以上人民政府主管部门批准的事业单位和章程或类似组织，并奖励愿意这样做的人主管税务机关批准的奖金或奖品免征个人所得税。
（3）持有财政部发行的债券和经国务院批准发行的金融债券具有利息的个人免征个人所得税。
（4）国务院《关于对储蓄存款利息征收个人所得税的实施办法》第5条规定：利息收入免征个人所得税。 ”
不要为已偿还的钱缴税，因为花在单位工作上的钱不是个人收入。这不包括在个人所得税的税收中，因此不支付个人所得税。
扩展数据：
根据《中华人民共和国个人所得税法》，《中华人民共和国个人所得税法实施条例》及相关文件和规定，个人的主要减免税政策所得税是：
蔡水子（1999）第267号进一步规定，应当获得按照国家或省地方政府规定比例缴纳的住房公积金，医疗保险基金，基本养老保险基金，失业保险基金。通过将其存入银行的个人帐户利息收入免征个人所得税。
Guo Shui Fa（1999）第180号文件还进一步规定，在中国工商银行开设教育存款专用帐户并享受优惠利率存款，对所得利息免征个人所得税。