扣除额的计算是基于对增值税链的全面考虑。
增值税计算原则：营业税-进项税差额
根据税法的规定，从农业生产者那里购买初级农产品的企业是免税的，因为农民无法开具特殊发票来提高指数税。这意味着从企业的角度来看，进项税为0，而农产品的销售税按17％计算。
例：
情况1，如果未根据免税额计算免税额
案例2，根据税法计算进项税减免额
通过以上示例，案例2显然更为合理。