不，任何想要您付款的人都将获得工伤证明和赔偿协议。
中华人民共和国企业所得税法
第10条在计算应纳税所得额时，不得扣除以下费用：
（8）与收入无关的其他支出。
您提到的专利侵权行为引起的赔偿费用应属于“与收入无关的其他费用”，因此不能从所得税中扣除。
补充：这里所说的与收入无关，这意味着侵权赔偿与从正常运作中获得的收入无关。