购买公司债券所赚取的利息确实要缴纳个人所得税,而银行扣除个人所得税的行为是一种付款方式。
根据现行的《中华人民共和国个人所得税法》及其实施条例,自1994年1月1日起,除国家发行的国债和金融债券的利息外,可以免征个人所得税,公司债券利息个人所得税的税率为20%。根据国家税务总局于2003年6月发布的《国家税务总局关于加强企业债券利息代扣代缴个人所得税的通知》(国税函〔2003〕612号)。个人获得的公司债券的赎回该机构负责代扣个人所得税。