公司所得税滞纳金的会计分录如下：
1.补充：
借：所得税
贷款：应付税款和企业所得税
2.付款：
借款：税费-企业所得税
借款：营业外支出-后期费用
贷款：银行存款
在附表3附表3“税收调整项目的详细信息”的第32行“ 12.滞纳税”中：第1栏“帐户金额”填写了纳税人根据国家统一会计法实际发生的滞纳税额系统。第三栏“调整量”等于第一栏；第二列“税额”和第四列“调整额”未填写。
不扣除公司所得税
因为滞纳金本来是惩罚性的，所以如果可以在税前扣除，那么就相当于一笔额外费用。
《中华人民共和国企业所得税法》第10条规定，在计算应纳税所得额时，不得扣除以下费用：
（1）支付给投资者的股利，股息和其他股权投资收益；
（2）企业所得税；
（3）滞纳金；
（4）罚款，罚款和没收财产；
（5）除本法第9条规定的支出以外的捐赠支出；
（6）赞助支出；
（7）未批准的准备金支出；
（8）与收入无关的其他支出。