如果这是公司工作性质所必需的体检费用，则不应征收个人医疗所得税；如果是具有福利待遇性质的体检费，则应将其纳入员工的当期工资和薪金收入中，并预扣和支付其个人所得税。
无需扣除个人所得税，可以使用体检发票扣除。
根据《个人所得税法》
第4条以下个人收入免征个人所得税：
1.由省级人民政府，国务院各部委和人民解放军上级单位以及外国政府颁发的科学，教育，技术，文化，卫生，体育，环境保护等奖项组织和国际组织；
2.国家债务和国家发行的金融债券的利息；
3.根据国家统一规定发放的补贴和津贴；
4.福利费，退休金和救济金；
五，保险赔偿；
第六，军事服务调动费和遣散费；
7.按照国家统一规定支付给干部和职工的安置费，退休金，退休工资，退休工资和退休生活津贴；
8.各国大使馆，领事官员和其他使馆和领事馆其他人员的收入，应按照中国的有关法律予以免税；
9.中国政府签署的国际公约和协定规定了免税收入；
10.国务院财政部门批准的免税收入。
保护员工的身心健康
【答案】《国家税务总局关于企业工资，薪金和职工薪酬扣除的通知》
“（国税函[2009] 3号）关于扣除员工福利费，为员工的医疗保健，生活，住房，交通等提供的各种补贴和非货币性福利的第3条，包括企业支付给出差雇员的医疗费用，未实施医疗统筹企业的雇员的医疗费用，对雇员直系亲属的医疗补贴，供暖补贴，为雇员提供的防暑和降温费，雇员困难补贴，救济费用，员工食堂费用补贴，员工交通补贴等待。
因此，根据上述规定，贵公司应将员工的体检费用计入福利费用中。
对于这部分费用，应代扣代缴个人所得税。
《中华民国个人所得税法实施条例》
“（中华人民共和国国务院第519号法令，2008年第519号规定：《税法》第二条所述个人收入的范围：（1）工资收入工资是指个人的工作或工资，薪金，奖金，年终工资增加，劳动红利，津贴，补贴和与就业或就业相关的其他收入。
第10条规定，个人收入形式包括现金，实物，有价证券和其他形式的经济利益。如果是实物收入，应根据所得凭证上的价格计算应纳税所得额；没有凭证或者凭证上注明的价格明显偏低的，应当参照市场价格核定应纳税所得额。如果所得是有价证券，则应根据票面价值和市场价格核定应纳税所得额。如果收入是其他形式的经济利益，应税收入应参照市场价格确定。