简而言之，税收筹划的风险是由于各种原因税收筹划活动失败而付出的代价。由于税收筹划是在采取经济行动之前做出的决定，并且税收法规对时间敏感，加上运营环境因素和其他因素的复杂性，因此不确定性并带来更大的风险。因此，企业在进行税收筹划时应充分考虑风险因素。
1.政策风险。税收筹划使用国家政策的风险来节省税收，称为政策风险。政策风险包括政策选择风险和政策变更风险。政策选择的风险是指政策选择是否正确的不确定性。这种风险主要是由于计划者对政策精神的了解不足，认识不全面，掌握不准确所致。也就是说，计划者认为所采取的行动符合国家政策精神，但实际上不符合国家法律法规。例如，一家服装厂接受单个操作员进行购买的按钮，但是由于它没有按照要求完成购买程序，因此在税务检查过程中，税务机关确认其为接受第三方发票，不仅取消了扣款，但也会受到相应的处罚政策变更的风险是指政策及时性的不确定性。为了适应市场经济的发展，反映国家的产业政策并及时调整经济结构，一国的税收政策无法固定。随着经济形势的发展，总是有必要做出相应的改变。（三）及时补充，修订，完善法律法规，不断废止旧政策，适时出台新法规。从这个意义上讲，政府的税收政策总是不规范的或相对短期的。例如，从1998年1月至1999年12月，为了抵御席卷1997年的东南亚金融危机的影响并刺激了外贸出口，国家税务总局已六次调整了出口退税政策，并且全国平均综合退税率有所提高。从1999年到2001年的三年中，为了适应市场经济发展的要求和国内外各种经贸形势的发展，中国的出口退税政策已经改变了11倍。根据《金融时报》，便利中央政府和地方政府重新分配税收，减轻政府的财政负担，缓解当前人民币面临的市场升值压力，并逐渐削弱中国在1998年亚洲金融危机后提高出口退税率的影响危机。开始降低出口退税率，即从目前的平均15％降至11％；同时取消羊毛，铅，焦炭，稀土，钨的出口退税； 2010年左右，将完全取消出口退税政策。从实践的角度来看，一旦实施该政策，那些依靠出口退税生存的企业将面临厄运，甚至有的企业将被摧毁。因此，这种计划外或时间紧迫的政策将对企业的税收筹划（尤其是中长期税收筹划）具有更大的风险。
2.操作风险。因为税收筹划的固有特征是与“法律”共舞，也就是说，税收筹划通常是在规定的税收法规的边缘进行，以帮助纳税人最大化其利益；再加上中国的税收立法体系水平高，立法技术水平不高法规的内容不仅含糊不清，而且法规之间也存在一些矛盾或冲突，甚至专业人员有时也难以准确把握，这给纳税人的税收筹划带来了很大的操作风险。从实践的角度来看，操作风险包括两个方面：一是相关税收优惠政策实施和实施不充分的风险，例如残疾人比例不足导致福利企业受益，可再生能源利用比例不足。资源。享受与环境保护有关的税收优惠。严格的税收筹划应该合法并符合立法者的意图，但是这种合法性仍需由税收行政执法部门确认。在此确认过程中，税务行政执法存在客观偏差，从而导致税务计划失败的风险。由于中国税法在具体税收事项上通常具有一定的灵活性，即在一定范围内，税务机关具有酌处权，税收行政执法人员的素质也参差不齐。这些是客观上的税政策实施方面的偏差提供了可能性。就是说，即使这是合法的税收筹划行为，其结果也可能是由于税收行政执法的偏差，税收筹划计划在实践中可能不起作用，从而使该计划成为空话。或被视为逃税或恶意避税。不仅不能获得节税的好处，而且会增加税收成本，从而导致税收筹划失败的风险。例如，中国的增值税法规定，个人销售商品的起征点为月销售额2,000至5,000元，提供应税服务的起征点为月销售额1,500至3,000元，每次纳税的起征点为（日）销售150元至200元，根据实际情况，各个地区可以确定上述范围内的具体门槛。因此，企业在进行税收筹划时，经常会遇到基层税务行政执法机构的观念冲突和行为障碍。这样的例子已经在媒体上公开，并且在实践中并不罕见。
此外，税收筹划还面临着风险，即筹划的结果和计划的成本不值得收益。例如，如果没有对企业状况的全面比较和分析，则计划成本大于计划结果；似乎有结果，但是实际上企业没有从中受益，等等。这些都是税收筹划过程中客观存在的风险，也是公司在税收筹划过程中应研究和注意的因素。