计算公司所得税时不能扣除保险公司的赔偿金，但计算增值税时可以扣除保险公司的赔偿金。
根据《企业所得税法实施条例》第四十六条，允许参加财产保险的企业扣除按照规定缴纳的保险费。企业购买理财产品的商业保险应当与具体情况区分开。如果属于财产保险范围，则按规定缴纳保险费可以扣除，否则不得扣除。
公司的员工商业保险是否在年底支付税款调整以支付公司所得税？是。
根据现行《企业所得税法实施条例》的有关规定：
第三十五条：企业按照国家有关主管部门规定的范围和标准，为职工缴纳基本养老保险费，基本医疗保险费，失业保险费，工伤保险费和生育保险费。理事会或省人民政府基本社会保险费和住房公积金可以扣除。
可以在国务院财税部门规定的范围和标准内扣除企业为投资者或雇员支付的补充养老保险费和补充医疗保险费。
第三十六条：企业为特殊工作人员缴纳的人身安全保险费以及可以由国务院财税部门扣除的其他商业保险费，由企业负担投资者或雇员商业保险费不能扣除。
根据《企业所得税法实施条例》的解释，这种保险费是一种强制要求企业为其雇员提供保险的人身安全保险，而不是公司自愿为其提供保险的所谓的人身安全保险。他们的员工。
《建筑法》（中华民国第91号总统令）第48条规定，建筑公司必须提供意外伤害保险，并为从事危险作业的雇员支付保险费。
《煤炭法》（中华民国第75号总统令）第44条规定，煤矿企业必须提供意外伤害保险并为煤矿地下工人支付保险费。
《保安服务管理条例》（中华人民共和国国务院第564号法令）规定，保安从业人员应根据保安服务的风险程度为保安员购买意外伤害保险。职位。
《高风险行业企业安全生产成本财务管理暂行办法》第18条规定，企业应为从事高海拔，高压等高风险作业的人员提供团体人身意外伤害保险。 ，易燃易爆，剧毒放射性和地雷。或人身意外伤害保险。
企业必须或应该按照国家规定为雇员提供的人身保险可以在税前扣除。
（2）其他商业保险
目前，尚无明确的规定可以由国务院财税部门扣除其他商业保险费。参照[2009] 33号第一条第八条的规定，企业出差旅行员工投保的航空事故保险可以在税前扣除。
企业根据相关行业法规购买的保险，参照企业[2009] 33号文的解释，属于国家法规购买的保险，应在税前扣除。例如，乘坐长途巴士旅行的雇员购买的公路客运承运人责任保险：
2004年7月1日实施的《公路运输条例》第36条规定，旅客运输经营者和危险品运输经营者应分别为承运人购买旅客或危险货物的责任保险。