如果公司的财务帐目健全且财务收支单完整，则税务机关无法根据公司当年的收支单方面核实公司所得税的征收情况。除非公司本身向税务机关申请评估企业所得税的征税方式，并经税务机关批准。
有下列情形之一的，应当核实应纳税所得额：
（1）可以正确地核算（验证）总收入，但是不能正确地计算（验证）总成本；
（2）总费用和支出可以正确核算（已验证），但总收入不能正确核算（已验证）
（3）通过合理的方法，可以计算和估计纳税人的总收入或成本。
提醒：如果纳税人有上述文件中的一种情况，应核实应税所得率。不属于上述情况的，核定应纳税额。以上规定仅适用于居民企业的纳税人。特殊措施，特殊类型的纳税人和一定规模以上的纳税人不适用于这些措施。
有下列情形之一的，纳税人应当以核定征收的方式征收企业所得税：
1.可能不按照税法，法规设立账簿的人，或者应按照税法，法规规定设立账簿但不设置账簿的人；
2.总收入只能被准确地说明，或者收入金额可以被确认，但是其成本却不能被准确地说明；
3.仅可以准确计算成本费用，或者可以验证成本费用，但不能准确计算总收入；
4.无法正确地计算总收入或成本费用，并且很难向主管税务机关核实真实，准确和完整的纳税信息；
5.尽管帐户设置和会计核算均符合规定，但未按要求保留相关的帐簿，凭证和相关的纳税材料；
6.如果发生纳税义务，则未在中华民国税法和规章规定的期限内处理纳税申报单，税务机关已命令纳税人在纳税申报期内申报。时间限制，但纳税人将不会在截止日期后宣布。