根据国税函[2010] 156号《关于跨区域建筑企业所得税征收管理有关问题的通知》：由建筑企业总部直接管理的跨区域项目部门以0.2为基础。项目实际营业收入的百分比总公司或每季度按季度将公司所得税预分配给项目所在地，项目部门应提前向当地主管税务机关缴纳。
建筑企业总公司应按照下列方法计算企业应缴纳的所得税总额并预缴：
（1）如果总部只有一个跨地区的项目部门，则在扣除项目部门预付的企业所得税后，将根据其余额当场支付；
（2）总部只有两个分支机构的，应按照国税发[2008] 28号的规定计算总部和分支机构的应纳税额；
（3）如果总公司既有跨地区项目部门直接管理，又有跨地区二级分支机构，则应先扣除项目部门预缴的企业所得税，然后按照国税[2008] 28号文件编号规定了总公司和分支机构应缴税款的计算方式。
文件进一步规定，建筑企业总部应按有关规定办理企业所得税的年度结算和清算，分支机构和项目部门不得进行结算。当总部的年终最终所得税的支付额少于预付税额时，总部的税务机关应对退税额进行处理或扣除下一年应缴纳的企业所得税。
关于加强企业所得税预缴的通知
省，自治区，中央直辖市以及计划分立的城市的国家税务局和地方税务局：
1.根据《中华人民共和国企业所得税法》及其实施规定，应按月或季度实际利润预缴企业所得税；根据上一个纳税年度的月度或季度应纳税所得额的平均值或根据税务机关批准的其他方法预先付款。为了确保及时存入税款，各级税务机关原则上应按照预缴实际利润的方法，对纳入地方重点税源管理的企业征收企业所得税。
其次，各级税务机关应根据企业所得税的预付款和最终结算情况，迅速检查当年企业所得税在应纳税企业所得税中所占的比例是否过低由于某些原因，请调整预付款方式或预付款税。
第三，各级税务机关必须处理公司所得税的预付款与缴纳和存储税款之间的关系。数字+结算付款）应不少于70％。
第四，各级税务机关应进一步加强监督管理。未按规定申报预缴企业所得税的，依照《中华人民共和国税收征收管理法》及其实施细则的有关规定处理。
第五，加强企业所得税的预付是税收征管的重要任务。各级税务机关要高度重视，认真部署，认真组织实施。国家税务总局将适时组织监督检查，并汇报此项工作的实施情况。
国家税务总局
2009年1月20日