在新《中华人民共和国企业所得税法》和《中华人民共和国企业所得税法实施条例》实施后，2008年以前民营非营利性医院免税的依据是财税[2000] 42号。自2008年1月1日起实施的《中华人民共和国企业所得税法》，地方税务部门表示，财税[2000] 42号关于所得税减免的规定将自动取消，有条件的民办非营利性医院也要缴纳所得税。
根据税法：
1.根据规章，对营利性医疗机构获得的收入征税。但是，为了支持营利性医疗机构的发展，如果营利性医疗机构获得的收入直接用于改善医疗和健康状况，则在获得医疗保险之日起三年内给予以下优惠执业注册：免征营业税；自行生产和自用的制剂免征增值税；对营利性医疗机构使用的房地产，土地，车辆和船舶免征房地产税，城市土地使用税以及车辆和船舶使用税三年免税期届满后，将恢复税收。
2.医院（诊所）的建立所产生的个人收入或个人合伙投资收入，应按照《个人所得税法》的规定和“个体工商户”的应税项目缴纳个人所得税。商户的生产经营收入”。
从问题上来看，所指的免税应免征营业税和相关的城市建设税，教育附加费，因此免税仍然是“具有成本效益的”。但是，免除上述税款并不意味着免征个人所得税。因此，仍然有必要按照税法的规定计算和缴纳个人所得税。
此外，纳税人的特定免税项目必须获得主管税务机关的免税批准。享受某种税种的减免税并不意味着您可以享受其他税种的减免税。
关于补充问题。
应当指出，尽管该问题免征营业税，但应将免税营业额确认为收入，并且由于免税而无法确认收入。因此，补充问题中的陈述是适当的。