该公司每季度发放一次奖金，其个人所得税与当月支付的工资一起计算。
公式：应付个人所得税=（薪金-个人缴纳五险一金）-个人所得税扣除额3500（元）*税率-快速计算扣除额；
示例：个人所得税金额=（薪金5,000元+季度奖金3000-个人缴纳五险一金的金额-个人所得税扣除额3500（元）*税率10％-快速计算扣除额105元= 345元。
附：个人所得税税率表（适用于工资和工资收入）
级每月应税收入税率（％）快速计算扣除：
1，当月应交税额不超过1500元时，税率为3％，速算扣除额为0。
2.整个月应纳税额超过1500元至4500元的部分的税率为10％。快速计算扣除105元；
3.整个月应纳税额超过4500元至9000元的部分的税率为20％。快速计算扣除555元；
注：本表所称全月应纳税所得额是指从每月收入额中扣除支出三千元和五百元后的余额（对于外国人员，按千元的要求元）或扣除其他扣除后的余额。
它是按季度累积的，并且预分配用于分配，没有季度奖金，并且根据以下方法计算年底的总奖金。
根据国家税务总局[2005] 9号文件《国家税务总局关于调整个人取得年度一次性红利的方式取得个人所得税的通知》，纳税人每年获得一次奖金作为对月薪和薪金收入进行计算和征税，代扣代缴人按照以下纳税计算方法缴纳时间预扣款：
（1）将雇员在当月获得的年度一次性奖金除以12个月，并根据其商数确定适用的税率和快速扣除额。
如果在发放年终一次性奖金的月份中，雇员的月薪和薪金收入低于税法规定的税收减免，则应扣除年度一次性奖金从“职工月薪与工资收入与费用扣除额之差”对于余额，应按上述办法确定全年一次性奖金的适用税率和速算扣除额。
（2）应根据适用的一次性奖金和本条第（1）项确定的快速计算扣除额计算税款，该扣除额是在月。
1.如果员工的月薪和薪金收入高于（或等于）税法规定的减税额，则适用公式为：
应付税款=员工当月全月的一次性奖金×适用的税率快速计算扣除
2.如果员工的月薪和薪金收入低于税法规定的减税额，则适用公式为：
应付税款=（员工全年获得的一次性奖金-员工的月薪与工资扣除额之差）×适用税率-快速计算扣除额
在一个纳税年度，每个纳税人只能使用一次纳税计算方法。