员工个人所得税不能抵消公司税。公司员工的个人所得税由个人承担，并从个人应纳税额中扣除。支付的税款不能再次从公司的税前扣除。
《中华人民共和国企业所得税法》
第10条在计算应纳税所得额时，不得扣除以下费用：
（1）支付给投资者的股息，红利和其他股权投资将获得支到的福利金；
（2）企业所得税；
（3）滞纳金；
（4）罚款，罚款和没收财产；
（5）除本法第9条规定的支出以外的捐赠支出；
（6）赞助支出；
（7）未批准的准备金支出；
（8）与收入无关的其他支出。一个
扩展配置文件：
第5条企业在每个纳税年度的总收入，在扣除非应税收入，免税收入，各种扣除额和允许弥补上一年亏损的余额后，应纳税收入。一个
（1）商品销售收入；
（2）提供劳务的收入；
（3）财产转让所得；
（4）股利，股息和其他股权投资收益；
（5）利息收入；
（6）租金收入；
（7）特许费收入；
（8）接受捐赠收入；
（9）其他收入。一个