面对责令整改的最后期限，情节严重的，将处以罚款。《中华人民共和国税收征收管理法》明确规定，不及时处理或者报告代扣代缴税款的纳税人，将在限期内面临税务机关的整改或者处一万元以下的罚款。
《中华人民共和国税收征管法》第62条规定，纳税人未在规定的期限内提交纳税申报表和纳税信息，或者扣缴义务人未向纳税人提交扣缴税款。税务机关在规定的期限内。税收征管报告表及有关资料，由税务机关责令限期改正，可以处2000元以下罚款；情节严重的，可处以2000元以上1万元以下的罚款。
扩展数据：
特别扣除个人所得税：
1.儿童教育：纳税人的子女全日制学历教育相关费用，按每个子女每月1000元的标准费率扣除。
3.住房贷款利息：纳税人或其配偶单独或一起使用商业银行或住房公积金个人住房贷款为其本人或其配偶购买在中国的住房。利息年按每月1000元的标准固定金额扣除，扣除期限不超过240个月。
四，房屋租金：直辖市，省会城市，计划城市和国务院确定的其他城市，扣除标准为每月1500元；市区户籍人口在100万以上的城市，扣除标准为每月1100元;城市登记人口不超过100万的城市，扣除标准为每月800元。
5.抚养老人：如果纳税人是独生子女，则扣除标准为每月2,000元；纳税人为非独生子女的，每月由同胞同胞扣除2000元。每月不超过1000元。