一是在返回组织所在地后，是否应在项目所在地重复缴纳个人所得税；第二个是所缴纳的个人所得税是否已在公司所得税前扣除。下面分别回答。
1.根据国家税务总局关于建筑安装行业跨省和异地工程人员个人所得税的征收和管理的公告，总承包企业和分包企业通过劳务派遣公司雇用劳务人员跨省和跨地区工作工资性收入所得的个人所得税，由劳务派遣公司依法代扣代缴，并向项目所在地的税务机关申报并缴纳。总承包企业，分包企业和劳务派遣单位所在的税务机关不得对其他地方的建筑工人的工资收入进行重复征税。
2.在任何情况下都不得在税前扣除个人所得税。原因如下：
1.个人所得税的纳税人是个人。企业仅行使预提义务，不承担税金，因此不能扣除。
2.如果企业为个人承担个人所得税，则属于《企业所得税法》第10条第8款，即与收入无关的其他支出。不能在税前扣除相同的费用。
根据国家税务总局关于建筑安装行业跨省和异地工程工人个人所得税征收和管理的公告，总承包企业和分包企业使用工资所得的个人劳动收入劳务派遣公司跨省和远程就业期间的工资和薪水。劳务派遣单位应当依法代扣代缴，并向项目所在地的税务机关申报代缴。
总承包企业，分包企业和劳务派遣公司所在的税务机关不得对不同地点的建筑工人赚取的应税工资和薪水重复征税。
扩展数据
除非税收法规另有规定，否则税前扣除的确认通常应遵循以下原则：
（1）权责发生制原则。也就是说，纳税人应在费用发生时而不是在实际支付时确认扣除额。
（2）匹配原理。也就是说，纳税人发生的费用应在费用匹配或分配期间报告并扣除。
纳税人在一个纳税年度应付的可扣减费用不能提前或延迟报告。
（3）关联性原则。也就是说，纳税人的可扣减费用必须与获得应课税收入的性质和来源有关。
（4）确定性原则。也就是说，每当支付纳税人的可抵扣费用时，都必须确定金额。
（5）合理性原则。也就是说，纳税人可抵扣费用的计算和分配方法应符合一般业务惯例和会计惯例。