1.税收筹划基础不稳造成的风险
中小企业需要良好的税收筹划基本条件。税收筹划的基础，是指企业管理决策水平的基本条件，以及相关人员对税收筹划的认识，企业的会计和财务管理水平以及企业与税收有关的诚信。如果中小型企业的管理决策层不了解或不重视税收筹划，或者甚至认为税收筹划是为了建立关系，寻找方法，利用漏洞并减少税收；企业还具有逃税的历史，或者有很多违反税法的行为等，导致税收筹划基础非常不稳定。在这样的基础上进行税收筹划具有极大的风险。这是中小企业在税收筹划中最重要的风险。
2.税收政策变更带来的风险。
税收政策变更是指国家税收法规及时性的不确定性。随着市场经济的发展和变化，国家产业政策和经济结构的调整，税收政策也必须不断变化，以适应国民经济的发展。因此，国家税收政策具有不规则或相对短期的影响。税收筹划是预先计划。每个税收筹划都需要一个从最初的项目选择到最终成功的过程。在此期间，如果税收政策发生变化，可以根据原始税收政策制定税收筹划方案。从法律方案到非法方案，或者从合理方案到不合理方案，都会导致税收筹划的风险。
3.不规范的税收行政执法造成的风险。
税收筹划和避税之间的本质区别在于，这是合法的，符合立法者的意图，但实际上，这种合法性仍然需要由税收行政执法部门确认。在确认过程中，由于不规范的税收行政执法，存在客观的税收筹划失败风险。无论哪种税种，税法在纳税范围上都有一定的灵活性。只要税法没有规定其行为，税务机关有权根据自己的判断确定是否应纳税。由于质量参差不齐等因素，客观上存在税收政策实施偏差的可能性。结果是，公司的合法税收筹划行为可能会导致税收筹划方案为空或由于税收行政执法的偏差而被认为是恶意的。逃税或逃税将受到处罚；或暂时违反公司税法的公司的税收筹划行为将被暂时忽略，使企业对税收筹划有一种幻想，并为未来的税收筹划风险埋下隐患。
4.因税收筹划目的不明确而引起的风险。
税收筹划活动是公司财务管理活动的组成部分。最大化税后利润只是税收筹划的分阶段目标，最大化纳税人的公司价值是其最终目标。因此，税收筹划应服务于公司财务管理的目标和实现公司战略管理的目标。如果企业税收筹划方法不符合生产经营的客观要求，那么过多的减税减税效果将干扰企业的正常经营和财务管理秩序，导致企业内部管理机制混乱，最终将给企业带来更大的潜在损失发生风险。税收筹划成本包括显性成本和隐性成本，其中显性成本是指在税收筹划方案中已考虑的执行税收筹划的所有实际成本。隐含成本是机会成本，是指纳税人由于采用计划的税收筹划计划而放弃的收益。例如，由于采用了获得税收优惠的计划，企业占用的资本数量增加了。占用资本的增加本质上是投资机会的损失。这是机会成本。在税收筹划的实践中，公司经常忽略这种机会成本，从而产生了计划收益和计划成本超过收益的风险。
税收筹划是为了使企业的价值最大化，它是一种方法和手段，而不是企业的最终目的。此时，如果您不清楚的话，可能还会做出错误的决定。