如果上级单位是业务单位，则只需开具3％的一般增值税发票即可进行项目评估。这3％是简单税款计算方法的收税率，不允许扣除进项税。计算得出3％所有增值税均已实际缴纳。
如果投入大于产出，并且还需要综合考虑缴税，那么在认证时（投入票），将保留较晚的日期以进行以后的认证（最长有效期为三个月），这将不作影响纳税。它也可以为接下来的几个月打下基础。此时，仅应将认证投入与产出之间的差额视为应纳税额，而不会进行其他帐户处理。
如果输入的票证已经过完全认证，并且不需要进行其他会计处理，则只需在声明表的扣除列中填写大于本月扣除额的输入部分，并将其保留即可以后扣除。
无论是一般纳税人在咨询期内增加预付增值税，还是将增值税的纳税期限定为预缴税款的第1、3、5、10、15天
借款：应付税款-应付增值税（已付税款）
贷款：银行存款
1.在月底，应付税款大于预付税款，余额
借：应交税额-应交增值税（转出未交增值税）
贷款：应付增值税-未付增值税
月底后的10天内
借：应缴增值税-未缴增值税
2.在月底时，月底应交税款少于预付税款，余额
贷款：应付税款-应付增值税（通过增值税转移）
多付的增值税将从下个月实现的增值税中扣除。
3.如果当月预缴了增值税，且进项税额大于销项税额。预付的增值税额
借：未缴税款的增值税
进项税额大于销项税额，不需要处理。余额为“保留的税收抵免”，并转移至下个月的“应付税款-应付增值税”。