医疗卫生机构的税收优惠政策分为三个部分：
（1）非营利性医疗机构的税收政策：非营利性医疗机构以国家规定的价格获得的医疗服务收入免征营业税。未按国家规定的价格获得的医疗服务收入，不享受本政策。
（2）营利性医疗机构的税收政策：对于营利性医疗机构直接获得的用于改善医疗条件的收入，应自获得执业资格之日起3年内，经审核并获得批准主管税务机关免征营业税。
（3）疾病控制机构和母婴保健机构等卫生机构的税收政策：疾病控制机构和母婴保健机构等卫生机构应按国家规定的价格取得卫生服务收入。免征营业税。
财税[2000] 42号《财政部国家税务总局关于医疗卫生机构有关税收政策的通知》明确规定：“对于营利性医疗机构的收入，应按照下列各项征收各种税款：规定...收入直接用于为改善医疗卫生条件，应当自领取开业医生登记之日起三年内给予下列优惠：取得医疗服务收入免征营业税；自行生产，自用的制剂免征增值税；，土地，车辆和船舶免征房地产税，城市土地使用税以及车辆和船舶使用税。三年免税期届满后将恢复税收。
根据法规，营利性医疗机构可以享受有条件的税收优惠政策。 1.免税期限是有限的。营利性医疗机构可享受3年（无限期）的免税政策。条件是有限的，也就是说，应将收入用于改善医疗和健康条件； （三）免税范围有限，免税不包括企业所得税； 4.免税是针对组织本身而不是其员工的，个人所得税仍必须基于法规。预扣税
1.增值税
财政部，国家税务总局，《关于全面实施营业税改增值税试点的通知》，财税〔2016〕36号。
附件3：关于将营业税转换为增值税的试点过渡政策的规定
以下各项免征增值税
（7）医疗机构提供的医疗服务。
医疗机构是指《医疗机构管理条例》（国务院令第149号）和《医疗机构管理条例实施细则》（卫生部令）的注册国务院第35号）执照医疗机构，以及各级军事和武装警察部队中的各种医疗机构。具体而言：各类医院，门诊（办公室），社区卫生服务中心（站），急诊中心（站），城乡卫生中心，疗养院（机构），疗养院，临床检验中心，各级政府和相关各部门组织的卫生防疫站（疾病控制中心），各专业疾病预防治疗站（机构），妇幼保健中心（站），妇幼保健机构，各级政府组织的儿童保健机构，和各级政府组织的血站（血液中心）和其他医疗机构。
本节中的“医疗服务”一词，是指医疗机构以不高于县（市）级和卫生主管部门相同水平的价格确定的医疗服务指导价（包括政府指导价）和其他有关部门并由供需双方按照规定等协商确定的价格，以提供《国家医疗服务价格项目规范》中所列的各种服务，并向医疗机构提供卫生，防疫，检疫的服务。社会。
2.《中华人民共和国耕地占用税暂行条例》
学校，幼儿园，疗养院和医院占用的耕地免收农田占用税。
3.财政部和国家税务总局关于医疗卫生机构有关税收政策的通知（财税〔2000〕42号）。
（1）非营利性医疗机构自行使用房地产和土地免征房地产税和城市土地使用税。
（2）为了支持营利性医疗机构的发展，如果从营利性医疗机构获得的收入直接用于改善医疗和健康状况，则应自以下日期起三年内给予以下优惠：取得执业注册的日期：营利性医疗机构使用自己的房地产和土地免征房地产税和城市土地使用税。三年免税期届满后，将恢复税收。
第四，财政部，国家税务总局，《关于非营利组织免征企业所得税问题的通知》，财税〔2009〕122号。
根据《中华人民共和国企业所得税法》第26条和《中华人民共和国企业所得税法实施条例》第85条（国务院令第512号） ），合格非营利组织的企业所得税免税收入的范围如下：
1.非营利组织的以下收入为免税收入：
（1）从其他单位或个人获得的收入；
（2）除《中华人民共和国企业所得税法》第7条规定的财政拨款外，其他政府补贴，但不包括政府购买服务所得的收入；
（3）根据省级以上民政，财政部门的规定收取的会费；
（4）产生非应税收入和免税收入的银行存款利息收入；
（5）财政部和国家税务总局规定的其他收入。