公司所得税应在单位所在地的主管税务局缴纳。根据规定，施工企业应当向施工现场（场外）税务局缴纳增值税，城市建设税和教育附加费。所得税在建筑工地预缴，并在公司所在地结算。
法规
《国家税务总局关于建筑企业所得税征收管理有关问题的通知》（国税函〔2010〕39号），涉及跨地区经营。关于建筑施工企业所得税征收管理问题的通知如下：
1.实行一般，分事业单位制的跨地区经营建筑企业，应严格按照国税发〔2008〕28号的规定，按照“统一计算，分级管理，局部预付款，简易清算”的规定执行。和财务调整“计算和缴纳企业所得税的方法。
2.跨地区的建筑公司设立的不符合二级分支机构要求的项目管理部门（包括项目指挥部门和与项目经理部门性质相同的合同部门）应为：汇总到总部或二级分支机构组织按照国税发[2008] 28号文件的规定统一计算并计算和缴纳企业所得税。
3.地方税务机关违反本通知的收集和管理文件，应予以暂停和改正；未按规定收取企业所得税的，应当及时退回对于企业。未按照本通知要求进行更正的，国家税务总局将按照执法责任制的有关规定严肃处理。
《国家税务总局关于建筑业企业所得税征收管理有关问题的通知》（国税函〔2010〕39号）基本解决了目前异地建设企业收取企业所得税的问题。根据施工现场的征收率征税对于全国的建筑公司来说，这是“好消息”。自从该文件于2010年1月26日发布以来，如果2009年的建筑业企业已在施工现场被地方税务机关征收了企业所得税，则它有权要求地方税务机关将其退还。