预付公司所得税不能在税前扣除以计算应纳税所得额，但应纳税所得额可用于计算应纳税额。
根据国税函[2010] 156号文件的规定，跨区域经营项目部（包括第二级以下分支机构管理的项目部）应当发布国家税务总局的《对外经营活动》。总部所在地地方税务机关“税收管理证书”，根据项目实际营业收入的0.2％，总行将企业所得税预分配到项目所在地，项目部预先向地方税务机关缴纳。施工企业总部在办理企业所得税预缴及最后清算时，应附有由施工企业总部直接管理的跨地区经营项目部门缴纳的当地预缴税款的纳税证明。因此，经主管税务机关核实并缴纳企业税后，可以扣除项目所在地地方税务部门签发的纳税证明和《对外经营活动税收管理证明》。。
根据国税函[2010] 156号《关于跨区域建筑企业所得税征收管理有关问题的通知》：由建筑企业总部直接管理的跨区域项目部门以0.2为基础。项目实际营业收入的百分比总公司或每季度按季度将公司所得税预分配给项目所在地，项目部门应提前向当地主管税务机关缴纳。
建筑企业总公司应按照下列方法计算企业应缴纳的所得税总额并预缴：
（1）如果总部只有一个跨地区的项目部门，则在扣除项目部门预付的企业所得税后，将根据其余额当场支付；
（2）总部只有两个分支机构的，应按照国税发[2008] 28号的规定计算总部和分支机构的应纳税额；
（3）如果总公司既有跨地区项目部门直接管理，又有跨地区二级分支机构，则应先扣除项目部门预缴的企业所得税，然后按照国税[2008] 28号文件编号规定了总公司和分支机构应缴税款的计算方式。
文件进一步规定，建筑企业总部应按有关规定办理企业所得税的年度结算和清算，分支机构和项目部门不得进行结算。当总部的年终最终所得税的支付额少于预付税额时，总部的税务机关应对退税额进行处理或扣除下一年应缴纳的企业所得税。
根据税法的有关规定，企业所得税实行“每年计算，每月或每季度预缴”的税款计算系统。在年底，纳税人支付少缴的所得税，应在次年支付；预付的所得税将在明年支付；如果付款后仍有余额，或者损失发生在下一年，应及时退还。
因此，前一年的预缴所得税可以在今年扣除。
此外，根据现行税法的有关规定，当企业每月或每季度预缴所得税时，其应纳税所得额可以弥补未补偿的应纳税所得额损失无需等待年终最终结算再次化妆。
如果所涉及的企业已按月或按季度预缴了所得税，并且已弥补了前一年未弥补的应纳税所得额损失，则该情况将不会出现。
关于补充问题。
上一年预缴的企业所得税是当年应缴纳的企业所得税抵减当年应缴纳的税款减去当年应缴纳的超额税款后的当年应交纳的实际税款。前一年。
根据国家税务总局关于印发《企业所得税清算缴纳管理办法》的规定（国税发〔2005〕200号）：纳税年度少于全年应付税款到期的，应当在清算期内清偿；如果预付税款超过全年应缴税款，主管税务机关应及时办理退税或于次年还清应纳税款。已付所得税。
有关退货仓库的具体程序和结算程序，请咨询当地的主管税务机关。