这取决于您的税务登记证是个人还是企业。如果是企业，则征收企业所得税；如果是个人，则征收企业所得税，而对生产经营中的个人所得税则不征收地方税。
公司只需要在税务机关缴纳企业所得税。您的公司最初是在当地税务局缴纳企业所得税。即使您以后在国税中有增值税业务，企业所得税仍将在当地税务局缴纳，而无需在当地税务局缴纳。国税局让您缴纳企业所得税是错误的。