员工的工资是应计的，税款也要按时提交。公司所得税的税前扣除没有问题
根据《中华人民共和国企业所得税法实施条例》第四十条，企业所发生的职工福利费用，可以扣除部分，不超过工资总额的14％。 。上述总工资是“应付工资”，包括以下六个部分，其中包括：（1）每小时工资； （2）计件工资（3）奖金； （4）津贴和补助（5）加班和加班工资（6）特殊情况下支付的工资。
如果工资不符合规定，则在计算和缴纳企业所得税时，应进行相应的税收调整。
（摘自财税字[1998] 018号和京果水二号[1998] 156号）
6。扣除软件开发公司的工资
（1）在计算应纳税所得额时，可以扣除软件开发企业实际支付的总工资。
将于1999年10月1日开始实施。
（摘自财税字[1999] 273号）
（2）前款所指的软件开发企业还必须满足以下条件：
1经省科学技术部门批准的文件和证书；
2开发销售的自行开发的软件，以满足特定的用户需求。软件产品采用存储介质（包括软盘，硬盘和光盘）的形式，用于记录计算机程序和相关文档；
3主要业务是开发和生产符合公司所得税纳税人条件的软件产品；
在4年中，自产软件的销售额占公司年总收入的35％以上；
在五年内，软件技术转让的收入占公司年总收入的50％以上（取决于在技术市场合同中的注册）；
在过去6年中，软件技术的研发支出占公司年总收入的5％以上。
（摘自国税发[2000] 24号和京国水[2000] 058号）
（3）软件企业人员的薪金和培训费用，可以按实际发生额缴纳企业所得税。
（摘自国发[2000] 18号）。
（3）应税工资标准
（1）财政部和国家税务总局《关于调整应税工资扣除额的通知》（财税字[1996] 43号）将应税工资的每月扣除额从550元调整为800元。元。具体的扣除标准，可以由省，自治区，直辖市人民政府根据当地不同行业在上述限制范围内确定，并报财政部和国家税务总局备案。确实需要超出限制的单个地区（省级）应在20％的范围内向财政部和国家税务总局报告。
在发布本通知之前，在财政部确认已实施20％的增长之后，在实施本通知的规定之后，是否可以在此基础上再提高20％本通知设定的人均减税限额省级人民政府应当自行决定，并向财政部和国家税务总局报告备案。
（摘自财税字[1999] 258号）
（摘自《 Jing Guo Shui [2000] 042》）
（4）纳税人的基础
1.在企业中工作或与该企业有雇佣关系的雇员包括固定雇员，合同工和临时工，但以下情况除外：
（1）应从已提取的员工福利费中支付医疗机构，员工浴室，美容室，幼儿园和托儿所的人员；
（2）领取了养老保险和失业救济金的退休职工，下岗职工和失业职工；
（3）出售房屋或租金收入的出租房屋的管理服务人员包括房屋周转基金；
（摘自国税发[2000] 84号）。
2.根据企业所得税暂行条例及其实施规则，并结合企业改革，裁员和增效的现状，在下列情况下，下列人员不列入纳税人基础：企业列出工资单：
（1）终止与该企业劳动合同的原始企业的雇员；
（2）尽管与企业的劳动合同关系尚未终止，但企业不支付基本工资和生活费；
（3）工资由员工福利，劳动保险等支付的工人。
本通知自2000年1月1日起实施。