新《中华人民共和国营业税暂行条例》颁布后，医疗机构为营利性和非营利性税收减免的文件中的营业税为《中华人民共和国营业税通知书》中的营业税。
非营利性医疗机构的政策是：（1）根据国家法规获得的医疗收入免征各种税款，并且以国家法规以外的价格获得的收入不符合此政策。
营利性医疗机构
1.营业税豁免和免税的范围
所有从事医疗服务的营利性医疗机构的收入均享受免税待遇。但是，其他非医疗服务收入（例如美容）应按照规定缴纳营业税。
2.企业所得税的征收
，经济性质属于普通股份制的营利性医疗机构应当按照规定征收企业所得税。原则上，企业所得税有两种征收方式。
1.批准的收藏。
2.收款。
3.个人所得税的征收
，其经济性质属于普通股份制的营利性医疗机构应按照规定征收个人所得税。个人所得税有两种征收方式。
2.根据实际申报收集。
4.独资经营和合伙制的个人所得税的征收
由个体经营和合伙制经济地拥有的营利性医疗机构，应征收投资者的个人所得税和非投资者的个人所得税按照规定，原则上也有两种收集方法。
五，房地产税，土地使用税，车辆和船只税
房地产税和土地使用税是在注册三年后收取的。车辆和船只税是自用的。
6.城市维护建设税和教育附加费，地方教育附加费
对于有利可图的医疗机构，城市建设税，教育附加费和地方教育附加费的征税基础是一致的。根据纳税人实际缴纳的营业税额。如果免征营业税，则无需缴纳增值税，并且无需缴纳城市建设税和教育附加费。
非营利性医疗机构：
1.计算非营利性医疗机构以国家设定的价格获得的医疗服务收入和未以国家设定的价格获得的医疗服务收入。州，其中按国家规定的价格获得的医疗服务收入免征各种税款。以国家规定的价格获得的医疗服务收入不符合本政策的条件。
2.来自从事非医疗服务的非营利医疗机构的收入。如租金收入，财产转让收入，培训收入，外商投资收入等，应按规定征收营业税和企业所得税。但是，非营利性医疗机构作为管理费和行政费获得的培训收入作为非应税收入包括在特别财政帐户的管理中，并且暂时不征收公司所得税。
3.非营利性医疗机构的房地产，土地，车辆和船只免征房地产税和城市土地使用税；对自用车辆和船舶征收车辆和船舶使用税。