通过香港公司支付的工资超过限额的内地人也应缴纳个人所得税。
根据《中华人民共和国个人所得税法》第1条，在纳税年度内在中国有住所或没有住所并在中国居住了183天的个人是居民个人。在中国境内和境外取得的居民个人收入，应依照本法的规定缴纳个人所得税。
没有居民并且在中国不居住的人，或者没有居民并且在纳税年度内在中国居住了少于183天的个人是非居民个人。来自中国的非居民个人收入应依照本法的规定缴纳个人所得税。纳税年度为公历的1月1日至12月31日。
扩展配置文件：
《中华人民共和国个人所得税法》第2条应针对以下个人收入缴纳个人所得税：
（1）工资收入；
（2）劳务报酬；
（3）手稿报酬；
（4）特许权使用费收入；
（5）营业收入；
（6）利息，股息和红利收入；
（7）物业租赁收入；
（8）财产转让收入；
（9）意外收入。
从前款第1项至第4项获得收入的个人居民（以下简称合并收入），应按照纳税年度计算个人所得税；非居民个人每月或每月从前款第1至4项获得收入个人所得税按项目计算。从前款第5项至第9项取得收入的纳税人，应当依照本法的规定另行计算个人所得税。