1.公司缴纳个人所得税的会计分录为：
1.计薪时：
借款：行政开支，工资等。
贷款：应付职工薪酬
2.支付工资时：
借款：应付职工薪酬
贷款：银行存款
应付税款-个人所得税等。
3.纳税时：
借款：税费-个人所得税
2.个人所得税是个人（自然人）对各种应税收入征收的税。调整税收征管机构与自然人（居民和非居民）之间的个人所得税税率管理过程中发生的社会关系的法律规范的总称。个人所得税纳税人，是指在中国有住所，没有住所但在中国居住了一年，没有在没有住所的情况下生活或未满一年但从中国获得收入的个人，包括中国公民，个体工商户，外国个人等
自2011年9月1日起，中国大陆的个人免税额将调整为3500元。
企业代扣代缴的个人所得税的会计处理
1.代扣代缴工资
预扣税：
库存现金
贷款：预扣税款和个人所得税
付款时：
借款：预扣税款和个人所得税
2.劳务（企业）预提和付款
借款：其他应收款-预付款-个人所得税
贷款：应付税款-应交个人所得税
借款：应付税费-应付个人所得税
3.基于工资的预扣和付款
借款：应付职工薪酬-薪金
4.业务预提和付款
借款：应交税金：应交个人所得税
扩展配置文件：
代扣代缴税时，代扣代缴代理人必须向纳税人开具由税务机关统一印制的代扣代缴税款和代收凭证，并指定纳税人的姓名，工作单位，家庭住址和居民身份个人信息，例如身份证或护照号码。纳税人要求扣缴义务人更换扣缴税款收据以扣缴税款的，扣缴义务人不得拒绝。
的代扣代缴人依法履行代扣代缴税款义务时，纳税人不得拒绝。纳税人拒绝的，扣缴义务人应当及时向税务机关报告处理，并暂时停止缴纳应纳税所得额。否则，应由纳税人代扣代缴。
扣缴义务人应当主动向税务机关申请代扣代缴税款的代扣税证明，并据此从纳税人中扣除。非正式的税收抵免券可以被纳税人拒绝。一个
参考：预扣和缴纳个人所得税的暂行办法
应付税费-知识库