如果这是公司工作性质所必需的体检费用，则不应征收个人医疗所得税；如果是具有福利待遇性质的体检费，则应将其纳入员工的当期工资和薪金收入中，并预扣和支付其个人所得税。
无需扣除个人所得税，可以使用体检发票扣除。
根据《个人所得税法》
第4条以下个人收入免征个人所得税：
1.由省级人民政府，国务院各部委和人民解放军上级单位以及国外颁发的科学，教育，技术，文化，卫生，体育，环境保护等奖项组织和国际组织；
2.国家债务和国家发行的金融债券的利息；
3.根据国家统一规定发放的补贴和津贴；
4.福利费，退休金和救济金；
五，保险赔偿；
第六，军事服务调动费和遣散费；
7.按照国家统一规定支付给干部和职工的安置费，退休金，退休工资，退休工资和退休生活津贴；
8.各国大使馆，领事官员和其他使馆和领事馆其他人员的收入，应按照中国的有关法律予以免税；
9.中国政府签署的国际公约和协定规定了免税收入；
10.国务院财政部门批准的免税收入。
它属于员工福利，我认为不应将其纳入工资和缴纳个人所得税中。