如果公司充当员工的住房补贴，则该收入属于员工的收入，并扣除税款。只有社会保障中包括的住房公积金可以免税。
根据《财政部和国家税务总局关于征收住房公积金，医疗保险基金和养老保险基金个人所得税的通知》（财税字[1997] 144号），发放住房补贴。由企业对个人该金额包括在接收者的当期工资和薪金收入中，并需缴纳个人所得税。
（注意：以上答案仅供参考，有关具体事宜，请咨询您的主管税务机关。）