对于股权变更，应当从相关费用和股本余额中扣除全部股权交易额，代扣代缴企业所得税，按照10％的税率计算。
如何确认股权交易金额取决于当地主管税务机关的交易判断和关联方交易的判断等因素。
纳税是公民的义务，而避税是非法的。对于自然人来说，转让有限责任公司股权的应纳税额通常可以采用以下方法；
1.有效利用知识产权和其他无形资产来避税。在转让股权之前，自然人股东将通过以自己的名义持有商标，专利或版权来预先增加公司的资本。因为评估价格是可控的，所以他们将大大增加自己的权益，并且能够尽量减少交易税的产生；
2.在股权转让前的某个时间（6个月至一年），通过增加坏账准备和其他财务安排等财务安排有效地减少了公司的净资产；
3.如果自然人股东仍然持有其他有限责任公司的100％，则他们可以通过商业交易，选择适当的交易和适用的税种来减少股权交易税的产生。