变更境外股权时，应当从有关费用和股本余额中扣除全部股权交易额，并按10％的税率计算预提企业所得税。
如何确认股权交易金额取决于当地主管税务机关的交易判断和关联方交易的判断等因素。
纳税是公民的义务，避税的操作空间相对较小，但是在政策允许的范围内，应进行税收筹划以减轻税收负担。关于自然人转让有限责任公司股权的税收负担，通常有以下几种方法：
1.有效利用知识产权和其他无形资产来避税。在转让股权之前，自然人股东将通过以自己的名义持有商标，专利或版权来预先增加公司的资本。因为评估价格是可控的，所以他们将大大增加自己的权益，并且能够尽量减少交易税的产生；
2.股权转让前的某个时间（6个月至一年），通过增加财务安排（例如计提坏账准备）有效地减少了公司的净资产；
3.如果自然人股东仍然持有其他有限责任公司的100％，则他们可以通过商业交易，选择适当的交易和适用的税种来减少股权交易税的产生。