首先，关联交易可能会增加公司的经营风险，使公司陷入财务困境，并可能产生坏账风险：如果大股东提供担保，资金，或者大股东以其他方式占用公司资金，它们将给公司带来潜在的风险。财务风险；与大股东及有关人员的不平等交易将减少公司的利润。
其次，它会影响公司的独立运营能力，并且其抵御外部风险的能力也会下降。太多的关联方交易会降低公司的竞争力和独立性，从而使公司过度依赖关联方，特别是大股东。例如，在一些公司中，原材料采购和产品销售的主要目标是关联方，并且其经营自主性受到许多限制。由于公司独立性差以及对关联方的依赖性强，因此市场竞争力下降。如果不能保证关联方本身，则公司可能会陷入低谷。
最后，发生大量关联交易将对公司形象产生负面影响，并减少潜在客户数量。潜在客户不愿与该公司打交道。公司的商誉将受到很大的损害，不利于公司的长期健康发展。
公司的控股股东，实际控制人，董事，监事和高级管理人员不得利用他们的关联关系损害公司的利益。违反前款规定给公司造成损失的，应当承担赔偿责任。
关连交易（Connected transaction）是企业关联方之间的交易。关连交易是在公司运营中经常发生的交易，容易产生不公平的结果。在市场经济条件下，关联方交易十分普遍。从有利的角度来看，由于关联方的关系，交易的双方可以节省商业谈判中的大量交易成本，并可以利用行政权力来确保优先执行商业合同，从而改善交易效率。消极的一面是，由于关联方可以利用行政权力来匹配交易，因此在非竞争条件下可能使交易的价格和方法不公平，从而可能侵犯股东或某些股东的权利。损害债权人的利益也很容易。
根据财政部于2006年颁布的《企业会计准则第36号-关联方的披露》（如果有一方控制，则由另一方共同控制）如果施加了重大影响，并且两个或多个当事方受同一方的控制，共同控制或重大影响，则它们构成关联方。
这里的控制权是指确定企业的财务和经营政策以及从企业的业务活动中获取利益的权利。所谓重大影响力，是指有权参与企业财务和经营政策的决策，但不能决定这些政策。参与决策的主要方式包括：派出董事会或类似机构的代表，参与决策过程以及交换管理人员。上述与关联方之间的资源或义务转移有关的所有事项，无论是否收取价格，均视为关联方交易。
在市场经济条件下，关联交易广泛存在，但它们与市场经济的基本原理不一致。根据市场经济原则，企业之间的所有交易应在市场竞争的原则下进行。在关联交易中，由于交易双方之间存在各种相关关系，因此涉及利益，并且交易未完全公开在竞争条件下。关联交易可能客观上影响企业的好坏。从有利的角度来看，由于交易双方之间存在关联关系，交易双方可以节省大量的商业谈判费用和其他方面的交易费用，并可以利用行政权力确保优先执行商业合同，从而提高交易效率。消极的一面是，由于关联方可以使用行政权力来匹配交易，因此在非竞争条件下交易的价格和方式可能会不公平，并侵犯股东或部分股东的权利。要全面规范关联方和关联交易的信息披露。
非公平关联交易者应承担某些法律责任。
不公平关联交易是指特定关联交易的实际内容是交易结果实质上是不公平的，这不利于交易的相关权益持有人，尤其是参与交易的非关联方的权利找的零钱。
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