水费和电费可以从应付税款中扣除（应交增值税），但是另一方必须开具增值税专用发票。但是，作为所得税减免项目，只要薪水在应税薪水范围内，水电费有发票，房租有发票并且都包含在成本中，则可以在扣除所得税前扣除。由于购买固定资产不是可扣减的输入，因此可以在折旧之前扣除。运费是指物料或商品买卖所产生的运输成本，必须根据运输发票上的税法，抵扣进项。成本中包含的部分可以在所得税前扣除。
水费单通常是按6％税率开具的普通发票，但它们不是特别票，因此不可抵扣。电力税率为16％，供电局也开具公司可以扣除的特殊发票。工业用水和工业用电的增值税率为17％。企业从供电局，供水局收到增值税发票后，可以抵扣进项税额。但是，污水处理费是作为普通发票发出的，没有进项税额减免。
有两种计算基本电费的方法，一种基于最大用电需求，另一种基于电量。中国对电容量超过315 kV•A的用户实行两部分电价。无论用户是否实际使用电能，他们都需要承担电费。
扩展数据
增值税特殊规定：
1.一般纳税人出售自己使用的，属于《中华人民共和国增值税暂行条例》第10条规定的不可抵扣且不扣减进项税的固定资产，根据汇总方法，收集率为3％增值税为2％。
2.对于出售使用过的固定资产的小规模纳税人，应按2％的税率减免增值税。
3.销售自己生产的以下商品的一般纳税人可以选择按照简单的方法，按照3％的征收率来计算和缴纳增值税：
（1）县级及县以下的小型水电单位生产的电力。小型水电是指由各种投资单位建设的装机容量小于50,000千瓦（包括50,000千瓦）的小型水电。
（2）用于建筑和建筑材料生产的沙，土和石材。
（3）用沙子，土壤，石头或我们自己挖掘的其他矿物连续生产的砖，瓦和石灰（不包括粘土实心砖，瓦）。